题目：Design of synthetic promoters for cyanobacteria with generative deep-learning model期刊：Nucleic Acids Research影响因子：19.16发表时间：2023.5.29原文作者：Euijin Seo

论文修改，通常是毕业论文的尾声环节。我们耗尽心血产出的依托答辩，此时将交由导师审阅。但！由于很多同学是第一次写论文，初稿往往不堪入目，直面论文的导师都很痛苦，光是导师的word评注，都能凑齐一本毒舌语录！也不能怪导师，毕竟很多同学自己都不愿意多看论文一眼... 具体哪种论文最折磨导师呢？我列举了一

2024年4月3日，Peter R. Girguis、Sergey Ovchinnikov、Yunha Hwang、Andre L. Cornman和Elizabeth H. Kellogg几人在Nature Communications上发表了一篇题为“Genomic language model

ImageGP从2017年推出后，稳定运行7年，因其使用简单方便，深受广大朋友们喜欢。独立IP访问60万次，日均使用1000次。如果您对编程不熟悉，使用ImageGP可以快速出图。只需轻轻点2两下，下面的美图就出来了如果您对编程很熟悉，有时临时画个图，还是ImageGP方便。有时想一下，R代码写的最

引言 /Introduction蛋白质设计领域知名学者 David Baker 和来自 20 个国家的 90 多位顶尖科学家共同签署了一份包含十个可执行承诺的保证书。该承诺旨在最大化人工智能在蛋白质设计领域的益处，同时最小化潜在风险。该社区声明源自 2023 年 10 月 25 日华盛顿大学蛋白质设

北京时间2024年3月15日，中国科学院分子植物科学卓越创新中心/中国科学院合成生物学重点实验室周志华研究员、赵国屏院士团队及中国科学院上海有机化学研究所马大为院士团队合作在国际知名学术期刊《自然-通讯》Nature Communications 发表了题为“Biosynthesis of the

点击蓝字 关注我们SeqKit2：序列和比对数据操作的瑞士军刀iMeta主页：http://www.imeta.science方法论文● 原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.191● 2024年4月5日，重庆医科大学附属第二医院沈伟在iMe

通讯点击蓝字 关注我们最全可视化集合工具EVenn使用手册iMeta主页：http://www.imeta.science研究论文● 原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.184● 2024年4月11日，中国中医科学院陈同、黄璐琦和中国农科院

科研进展理解基因组的动态特性是当前基因组学研究的前沿方向之一。eccDNA（染色体外环状DNA）作为真核生物基因组的重要组成部分，在人类等物种中已被证实具有丰富且重要的生物学功能，但在植物中的研究尚属空白。水稻作为单子叶模式植物和重要粮食作物，开展其eccDNA的系统研究，将有助于从新的角度认识水稻

基因组结构变异与丰富多彩的生物性状进化和严重疾病表型密切相关。多种遗传病和癌症的变异研究需要在多个样本之间进行基因组变异差异比较，进而获得真正与疾病进展相关的新生（de novo）和体细胞（Somatic）结构变异。目前，领域内常用的“先检测再求差”的分步式策略要求在基因组检测后有多个计算步骤，繁杂

植物基因组学研究为植物基因功能、群体遗传、进化和育种研究提供了重要基因组数据资源。近日，浙江大学樊龙江教授课题组在国际知名期刊Nature Plants发表了题为“Technology-enabled great leap in deciphering plant...

点击右上角，免费注册登录后，点击 Personal center进入个人中心，可以管理文件、管理运行过的工具的记录、管理运行过的流程的记录。 工具或流程的结果可以发给同学或同事查看。 再分析链接可以基于之前的参数继续修...

点击蓝字 关注我们癌症进展中"营养-真菌-宿主"三方的相互作用iMeta主页：http://www.imeta.science综  述● 原文链接DOI: https://doi.org/10.1002/imt2.170● 2024年1月26日，上海交通大学刘宁宁团队在

原文信息：Yang, Y., Coyte, K.Z., Foster, K.R. et al. Reactivity of complex communities can be more important than stability. Nat Commun 14, 7204 (2023). ht

斯卑尔脱小麦（T. aestivum ssp. spelta）是古老的小麦栽培种，早在公元前6000-5000年就种植于近东地区和欧洲各地，目前在德国、瑞典、瑞士等国家仍有少量种植(Schlumbaum et al., 1998; Akeret, 2005)。斯卑尔脱小麦（T. spelta L.）

几个月前就听说华大万物联合上海师范大学开发了基因组选择的工具CropGS，一直比较好奇。近日文章已经发表见刊，得以一窥究竟。黄学辉老师Lab及徐扬老师都是领域内专家主要内容以往的作物GWAS数据库集中在表型和基因型之间的关联，只有少数数据库充分利用表型和基因型资源来构建和托管农艺性状的基因组预测模型

生物信息分析离不开数据资源和数据库，生物信息学数据库分类概览 (第一版)系统梳理了常用功能数据库。下面再分享9个我们承建发表的数据库，5篇NAR，一篇BIB，一篇Nature protocols，2篇Science Bulletin，一篇iMETA，一篇APSB，一篇 Nature Genetics

点击蓝字 关注我们2023年影响因子预测: 微生物学期刊经过Web of Science 官网对微生物学领域引用前30和IF排名前30的期刊进行了2023年影响因子预测。结果显示，47本微生物学期刊2023年影响因子平均IF下降了17%，仅有5本增长，剩余42本均下降，其中IF增长最大的仅有7.74

2024年3月22日至24日，由中国细胞生物学学会功能基因组信息学与系统生物学分会主办，温州医科大学附属眼视光医院、温医大基因组医学研究院承办，瓯江实验室、中国康复技术转化及发展促进会眼科康复专业委员会、浙江省生物信息学学会、温州谱希基因科技有限公司协办的“首届全国基因组医学系列论坛-基因组医学与人

1 单位介绍北京大学干细胞再生医学中心是我国最早成立的专业干细胞研究中心之一，是北京大学直属的干细胞生物工程研究基地、基金委批准的基础科学中心、教育部批准的“再生医学工程研究中心”、科技部批准的“国家级国际合作联合研究中心”。中心已经建立了细胞遗传操作研究所需的各种技术体系，如基因打靶、多能细胞的分

2023年度中医药十大学术进展发布 IMP 入选为推动我国生物信息学的学科发展和创新研究，充分展示和宣传我国生物信息学领域的重大研究成果，《基因组蛋白质组与生物信息学报（英文）》（Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 简称GPB）组织评选了2018年度

福利公告：为了响应学员的学习需求，经过易生信培训团队的讨论筹备，现决定安排扩增子16S分析、宏基因组、转录组的线上/线下同时开课。报名参加线上直播课的老师可在1年内选择参加同课程的一次线下课 。期待和大家的线上线下会晤。目前可以通报的信息：转录组线上/线下开课时间：2024/04/19-2

珊瑚礁由于全球气候变化而面临着前所未有的威胁，这些气候变化包括海温上升、海洋酸化和污染等。保护石珊瑚及其所处的环境对海洋生态系统的健康和多样性至关重要。近年来，虽然关于石珊瑚转录组和基因组的研究已有报道，但石珊瑚的独特性质对其基因组组装提出了挑战，高度杂合性和外源序列污染阻碍了高质量石珊瑚基因组的组

沈宁课题组学生作图，展现练轻功的少年准确找到还未盛开的融合荷花，暗喻Anchored-fusion技术高灵敏检测到融合基因。基因融合是癌症产生的最重要的驱动因素。基因融合的及时诊断对癌症患者的肿瘤分型、分级、分期，有针对性的治疗方法的设计以及疾病进展及预后的评估有着至关重要的意义。基于转录组测序数据

本期分享的文献是2022年5月发表在《Molecular Plant》期刊上的研究性论文，题为“Major episodes of horizontal gene transfer drove the evolution of land plants”。水平基因转移(HGT)是跨物种的遗传物质交换，

01【科学背景】原子尺度模拟已成为提供实验观察现象微观解释的宝贵计算工具，但传统的物理模型势函数在计算成本、准确性和广泛适用性之间存在权衡，尤其在模拟反应化学时更为明显。传统的力场和量子力学方法在计算成本和适用范围上存在限制，而反应力场则需要根据预定的反应进行重新参数化，量子力学方法的计算成本对许多

今天凌晨，OpenAI 宣布， ChatGPT 无需注册就能立即使用。目前每周有来自全球 185 个国家和地区的 1 亿多人在使用 ChatGPT 获取新知识，OpenAI 正在逐步开放这项服务，旨在让所有对人工智能感兴趣的人都能更轻松地使用它。所以从今天起，只要进入 ChatGPT 官网，就能立刻