ChIP-seq基本分析流程
生信宝典
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2020-02-04 23:26
前年在中科院做培训时，整理了一套ChIP-seq分析流程，截选实战部分，略作修改，分享出来，希望大家指正。
那次培训内容比较杂，还有关于TCGA、ICGC、ProteinAtlas等数据库的使用, 前面已经分享过，链接如下：
下面步入正题，这套流程从ChIP-实验、测序注意事项、测序深度，到分析整体流程，再到每一步如序列比对，富集效率评估、热图、峰图可视化，deeptools2使用、peak calling和motif分析等。
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