原F1000Prime推荐:ACE2泛癌分析图谱(TCGA数据库挖掘)-技术圈

新冠肺炎病毒来势汹汹，成为一场席卷全球的突发公共卫生事件，通过临床数据可知在新型冠状肺炎尤其是重症病例中，很多都是老年人或合并其他基础疾病的患者，肿瘤患者由于自身处于免疫异常状态，加之手术、放化疗等治疗造成免疫力进一步低下，更是易被这个“恃强凌弱”的病毒趁虚而入。然而恶性肿瘤类型繁多，何种恶性肿瘤患者更易感染肿瘤？其中可能存在何种生物分子机制？

为了解决该疑问，上海交大医学院附属第九人民医院眼科柴佩韦博士和范先群教授首次绘制ACE2泛癌分析图谱，揭示ACE2高表达的肿瘤患者更易罹患新冠肺炎，论文近期发表于Journal of hematology and oncology（《血液学与肿瘤学杂志》）（IF:8.731 ）,并同期被列为网页封面文章。

ACE2是人类血管紧张素转换酶同源物，是一种锌金属蛋白酶，属于1型跨膜蛋白，在病毒感染过程中，ACE2是新冠病毒的膜上结合受体，与病毒和宿主细胞的融合、入侵过程有关。也就是说，ACE2是新冠肺炎病毒感染的“导火线”。

研究人员利用cBioportal、UALCAN和gepia2等生物信息学分析工具，纳入肿瘤基因组计划(The Cancer Genome Atlas，TCGA)数据库中30余类恶性肿瘤，在10953例肿瘤患者中针对遗传变异（拷贝数变异、突变等）、RNA表达、DNA甲基化、预后趋势分析等方面进行研究，发现肿瘤中可出现ACE2突变、拷贝数异常扩增等多种遗传学异常。同时，在结肠腺癌、肾乳头状细胞癌、胰腺癌、直肠腺癌、胃腺癌和肺腺癌等六种恶性肿瘤中ACE2表达显著上调，并伴有ACE2启动子区DNA甲基化异常。

UCSC XENA - 集大成者(TCGA, ICGC)
ICGC数据库使用
TCGA数据库在线使用
BROAD开发的TCGA分析平台，强大的下载功能
cBioPortal功能强大的TCGA再分析平台
这是数据更新最实时的TCGA网站，功能强大

由于ACE2是新冠肺炎病毒结合的靶标蛋白，因此ACE2高表达的患者相对暴露风险增高，对新冠肺炎病毒更易感。该研究结论也与何建行教授、谢丛华教授团队此前发表于《柳叶刀-肿瘤》的研究结果相一致（肺腺癌患者占总体患者比例高，癌症是新冠肺炎感染的独立危险因素）。

总的来说，研究提示一方面由于新冠病毒传染性极强，且部分癌症患者ACE2表达增高，癌症患者应加强个人防护；另一方面若患有癌症的患者感染新冠病毒，出现重症、死亡的可能增高，应加强监测治疗并优先处理。

研究人员也提到，由于本研究基于肿瘤患者队列的生物信息学研究，因此仅起提示作用，相关结论仍需要后续大规模的临床队列研究证实。

值得一提的是，该研究于5月15日得到长期致力于肿瘤药物研发的西印度大学医学院教授Maxine Gossell-Williams教授的强力推荐，列为世界学术组织“Faculty Opinions”推荐论文，并进行点评，评价该研究为新冠肺炎的诊疗提供了有效参考模型。

Faculty Opinions(原F1000Prime，于2020年4月12日改名为Faculty Opinions)是国际生物医学领域重要的学术论文评估机构，由全球近8000名生物学和医学领域的顶尖科学家组成。“Faculty Opinions”中的科学家从每年所发表的生物医学论文中评选出一小部分（不足千分之二）最重要的文章，推荐给全世界的生物学和医学工作者，并对论文加以评论，研究论文能被Faculty Opinions点评与收录，代表着该论文有较高的学术水平和重要的科学价值。