推荐几个单细胞数据分享和展示平台 | 短视频演示

共 1093字,需浏览 3分钟

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2021-03-18 22:57

Broad的单细胞数据分享和展示平台

  • 可选择子类展示

  • 映射单个基因的颜色到t-SNE/UMAP图

  • 分屏展示Cluster着色图和单基因着色图

  • 多基因热图、Dotplot、Boxplot、Violinplot展示

  • 部分图可导出矢量图格式


视频2-4分钟,都没有声音,可直接播放

UCSC single cell browser

  • 细胞t-SNE/Umap图可按metadata中很多属性着色

  • 可查找定位关注的细胞、细胞簇

  • 可着色单基因的表达图

  • 可自定义颜色

  • 可分屏展示2种颜色映射方式


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Cell X Gene

  • 一个Python包,可部署到本地电脑或自己服务器展示

  • 可按多种细胞属性着色

  • 可绘制2个基因的表达相关性点图

  • 可按单基因表达着色

  • 可选择2个簇进行差异基因分析


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ASAP在线单细胞分析平台

  • 可在线进行单细胞分析

  • 展示功能多出一个三维展示,其它无明显特色


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