MedMNIST:上海交大发布医学影像领域的MNIST(附下载)

小白学视觉

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2022-07-09 18:58

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今天上海交大的研究学者发文 MedMNIST Classification Decathlon: A Lightweight AutoML Benchmark for Medical Image Analysis ,公布了其收集整理的10个医学领域的图像数据集MedMNIST,旨在促进AutoML(自动机器学习)在医学领域的技术研究。


作者信息:


这10个数据集示例:



该数据集特点:


  • 利于研究教学:数据来自具有知识共享(CC)许可的多个开放式医学图像数据集,易于用于教育目的。

  • 标准化:将数据预处理为相同格式,无需用户了解任何背景知识

  • 多样性:涵盖了各种数据规模(从100到100,000)和任务(二分类/多类分类,有序回归和多标签学习)。

  • 轻量级:28×28的图像大小适合快速原型设计和试验多模态机器学习和AutoML算法。


该数据集相关统计:



可见覆盖了常见的医学影像数据源:病理图片、胸部X光、皮肤镜、超声、眼底摄影、OCT、CT等。


另外,作者提供了代码,在此10个数据集上进行了人工设计网络和常见AutoML工具设计的模型的评测,结果如下:



可见:

  • Google AutoML Vision 在大多数情况下都表现不错,但相比手工设计的 ResNet-18/50也有逊色的时候;

  • auto-sklearn 的表现一直很稳定的差 /sad;

  • AutoKeras 在数据量较大的数据集上表现很好,在数据量小时往往不佳。


总之,以上AutoML工具在MedMNIST面前没有完美胜出者,这也说明MedMNIST对于研究者来说是个好数据集。

最后附上项目主页:

https://medmnist.github.io/

论文地址:

https://arxiv.org/abs/2010.14925

Demo代码地址:

https://github.com/MedMNIST/MedMNIST

好消息!

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