一文读懂PyTorch中Dataset与DataLoader
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2021-09-12 16:07
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作者 | Chenllliang@知乎(已授权)
来源 | https://zhuanlan.zhihu.com/p/105578087
编辑 | 极市平台
导读
Dataset 是 DataLoader 实例化的一个参数,本文先从 Dataset 的源代码讲起,然后讲 DataLoader 中的主要函数,让大家学会自定义自己的数据集。
深度时代,数据为王。
PyTorch 为我们提供的两个 Dataset 和 DataLoader 类分别负责可被 Pytorch 使用的数据集的创建以及向训练传递数据的任务。如果想个性化自己的数据集或者数据传递方式,也可以自己重写子类。
Dataset 是 DataLoader 实例化的一个参数,本文先从 Dataset 的源代码讲起,然后讲 DataLoader,关注主要函数,少细枝末节,让大家学会自定义自己的数据集。
ps:本文搬运自作者的博客 陈亮的博客 | Liang's Bloghttps://chenllliang.github.io,里面有一些完成/待完成的文章,欢迎大家一起交流。
Dataset
什么时候使用Dataset
CIFAR10是CV训练中经常使用到的一个数据集,在PyTorch中CIFAR10是一个写好的Dataset,我们使用时只需以下代码:
data = datasets.CIFAR10("./data/", transform=transform, train=True, download=True)
datasets.CIFAR10就是一个Datasets子类,data是这个类的一个实例。
我们有的时候需要用自己在一个文件夹中的数据作为数据集,这个时候,我们可以使用ImageFolder这个方便的API。
FaceDataset = datasets.ImageFolder('./data', transform=img_transform)
如何自定义一个数据集
torch.utils.data.Dataset 是一个表示数据集的抽象类。任何自定义的数据集都需要继承这个类并覆写相关方法。
所谓数据集,其实就是一个负责处理索引(index)到样本(sample)映射的一个类(class)。
Pytorch提供两种数据集:Map式数据集 Iterable式数据集
Map式数据集
一个Map式的数据集必须要重写getitem(self, index),len(self) 两个内建方法,用来表示从索引到样本的映射(Map).
这样一个数据集dataset,举个例子,当使用dataset[idx]命令时,可以在你的硬盘中读取你的数据集中第idx张图片以及其标签(如果有的话);len(dataset)则会返回这个数据集的容量。
自定义类大致是这样的:class CustomDataset(data.Dataset):#需要继承data.Dataset
def __init__(self):
# TODO
# 1. Initialize file path or list of file names.
pass
def __getitem__(self, index):
# TODO
# 1. Read one data from file (e.g. using numpy.fromfile, PIL.Image.open).
# 2. Preprocess the data (e.g. torchvision.Transform).
# 3. Return a data pair (e.g. image and label).
#这里需要注意的是,第一步:read one data,是一个data
pass
def __len__(self):
# You should change 0 to the total size of your dataset.
return 0
例子1:自己实验中写的一个例子:这里我们的图片文件储存在“./data/faces/”文件夹下,图片的名字并不是从1开始,而是从 final_train_tag_dict.txt 这个文件保存的字典中读取,label 信息也是用这个文件中读取。大家可以照着上面的注释阅读这段代码。
from torch.utils import data
import numpy as np
from PIL import Image
class face_dataset(data.Dataset):
def __init__(self):
self.file_path = './data/faces/'
f=open("final_train_tag_dict.txt","r")
self.label_dict=eval(f.read())
f.close()
def __getitem__(self,index):
label = list(self.label_dict.values())[index-1]
img_id = list(self.label_dict.keys())[index-1]
img_path = self.file_path+str(img_id)+".jpg"
img = np.array(Image.open(img_path))
return img,label
def __len__(self):
return len(self.label_dict)
下面我们看一下官方MNIST数据集的例子。
class MNIST(data.Dataset):
"""`MNIST <http://yann.lecun.com/exdb/mnist/>`_ Dataset.
Args:
root (string): Root directory of dataset where ``processed/training.pt``
and ``processed/test.pt`` exist.
train (bool, optional): If True, creates dataset from ``training.pt``,
otherwise from ``test.pt``.
download (bool, optional): If true, downloads the dataset from the internet and
puts it in root directory. If dataset is already downloaded, it is not
downloaded again.
transform (callable, optional): A function/transform that takes in an PIL image
and returns a transformed version. E.g, ``transforms.RandomCrop``
target_transform (callable, optional): A function/transform that takes in the
target and transforms it.
"""
urls = [
'http://yann.lecun.com/exdb/mnist/train-images-idx3-ubyte.gz',
'http://yann.lecun.com/exdb/mnist/train-labels-idx1-ubyte.gz',
'http://yann.lecun.com/exdb/mnist/t10k-images-idx3-ubyte.gz',
'http://yann.lecun.com/exdb/mnist/t10k-labels-idx1-ubyte.gz',
]
raw_folder = 'raw'
processed_folder = 'processed'
training_file = 'training.pt'
test_file = 'test.pt'
classes = ['0 - zero', '1 - one', '2 - two', '3 - three', '4 - four',
'5 - five', '6 - six', '7 - seven', '8 - eight', '9 - nine']
class_to_idx = {_class: i for i, _class in enumerate(classes)}
@property
def targets(self):
if self.train:
return self.train_labels
else:
return self.test_labels
def __init__(self, root, train=True, transform=None, target_transform=None, download=False):
self.root = os.path.expanduser(root)
self.transform = transform
self.target_transform = target_transform
self.train = train # training set or test set
if download:
self.download()
if not self._check_exists():
raise RuntimeError('Dataset not found.' +
' You can use download=True to download it')
if self.train:
self.train_data, self.train_labels = torch.load(
os.path.join(self.root, self.processed_folder, self.training_file))
else:
self.test_data, self.test_labels = torch.load(
os.path.join(self.root, self.processed_folder, self.test_file))
def __getitem__(self, index):
"""
Args:
index (int): Index
Returns:
tuple: (image, target) where target is index of the target class.
"""
if self.train:
img, target = self.train_data[index], self.train_labels[index]
else:
img, target = self.test_data[index], self.test_labels[index]
# doing this so that it is consistent with all other datasets
# to return a PIL Image
img = Image.fromarray(img.numpy(), mode='L')
if self.transform is not None:
img = self.transform(img)
if self.target_transform is not None:
target = self.target_transform(target)
return img, target
def __len__(self):
if self.train:
return len(self.train_data)
else:
return len(self.test_data)
def _check_exists(self):
return os.path.exists(os.path.join(self.root, self.processed_folder, self.training_file)) and \
os.path.exists(os.path.join(self.root, self.processed_folder, self.test_file))
def download(self):
"""Download the MNIST data if it doesn't exist in processed_folder already."""
from six.moves import urllib
import gzip
if self._check_exists():
return
# download files
try:
os.makedirs(os.path.join(self.root, self.raw_folder))
os.makedirs(os.path.join(self.root, self.processed_folder))
except OSError as e:
if e.errno == errno.EEXIST:
pass
else:
raise
for url in self.urls:
print('Downloading ' + url)
data = urllib.request.urlopen(url)
filename = url.rpartition('/')[2]
file_path = os.path.join(self.root, self.raw_folder, filename)
with open(file_path, 'wb') as f:
f.write(data.read())
with open(file_path.replace('.gz', ''), 'wb') as out_f, \
gzip.GzipFile(file_path) as zip_f:
out_f.write(zip_f.read())
os.unlink(file_path)
# process and save as torch files
print('Processing...')
training_set = (
read_image_file(os.path.join(self.root, self.raw_folder, 'train-images-idx3-ubyte')),
read_label_file(os.path.join(self.root, self.raw_folder, 'train-labels-idx1-ubyte'))
)
test_set = (
read_image_file(os.path.join(self.root, self.raw_folder, 't10k-images-idx3-ubyte')),
read_label_file(os.path.join(self.root, self.raw_folder, 't10k-labels-idx1-ubyte'))
)
with open(os.path.join(self.root, self.processed_folder, self.training_file), 'wb') as f:
torch.save(training_set, f)
with open(os.path.join(self.root, self.processed_folder, self.test_file), 'wb') as f:
torch.save(test_set, f)
print('Done!')
def __repr__(self):
fmt_str = 'Dataset ' + self.__class__.__name__ + '\n'
fmt_str += ' Number of datapoints: {}\n'.format(self.__len__())
tmp = 'train' if self.train is True else 'test'
fmt_str += ' Split: {}\n'.format(tmp)
fmt_str += ' Root Location: {}\n'.format(self.root)
tmp = ' Transforms (if any): '
fmt_str += '{0}{1}\n'.format(tmp, self.transform.__repr__().replace('\n', '\n' + ' ' * len(tmp)))
tmp = ' Target Transforms (if any): '
fmt_str += '{0}{1}'.format(tmp, self.target_transform.__repr__().replace('\n', '\n' + ' ' * len(tmp)))
return fmt_str
Iterable式数据集
一个Iterable(迭代)式数据集是抽象类data.IterableDataset的子类,并且覆写了iter方法成为一个迭代器。这种数据集主要用于数据大小未知,或者以流的形式的输入,本地文件不固定的情况,需要以迭代的方式来获取样本索引。
关于迭代器与生成器的知识可以参见博主的另一篇文章Python迭代器与生成器介绍及在Pytorch源码中应用。
DataLoader
Data loader. Combines a dataset and a sampler, and provides an iterable over the given dataset. —— PyTorch Documents
一般来说 PyTorch 中深度学习训练的流程是这样的:1. 创建Dateset 2. Dataset传递给DataLoader 3. DataLoader迭代产生训练数据提供给模型
对应的一般都会有这三部分代码
# 创建Dateset(可以自定义)
dataset = face_dataset # Dataset部分自定义过的face_dataset
# Dataset传递给DataLoader
dataloader = torch.utils.data.DataLoader(dataset,batch_size=64,shuffle=False,num_workers=8)
# DataLoader迭代产生训练数据提供给模型
for i in range(epoch):
for index,(img,label) in enumerate(dataloader):
pass
到这里应该就PyTorch的数据集和数据传递机制应该就比较清晰明了了。Dataset负责建立索引到样本的映射,DataLoader负责以特定的方式从数据集中迭代的产生 一个个batch的样本集合。在enumerate过程中实际上是dataloader按照其参数sampler规定的策略调用了其dataset的getitem方法。
参数介绍
先看一下实例化一个DataLoader所需的参数,我们只关注几个重点即可。
DataLoader(dataset, batch_size=1, shuffle=False, sampler=None,
batch_sampler=None, num_workers=0, collate_fn=None,
pin_memory=False, drop_last=False, timeout=0,
worker_init_fn=None)
参数介绍:dataset
(Dataset) – 定义好的Map式或者Iterable式数据集。batch_size
(python:int, optional) 一个batch含有多少样本 (default: 1)。shuffle
(bool, optional) – 每一个epoch的batch样本是相同还是随机 (default: False)。sampler
(Sampler, optional) – 决定数据集中采样的方法. 如果有,则shuffle参数必须为False。batch_sampler
(Sampler, optional) 和 sampler 类似,但是一次返回的是一个batch内所有样本的index。和 batch_size, shuffle, sampler, and drop_last 三个参数互斥。num_workers
(python:int, optional) 多少个子程序同时工作来获取数据,多线程。(default: 0) collate_fn
(callable, optional) 合并样本列表以形成小批量。pin_memory
(bool, optional) 如果为True,数据加载器在返回前将张量复制到CUDA固定内存中。drop_last
(bool, optional) – 如果数据集大小不能被batch_size整除,设置为True可删除最后一个不完整的批处理。如果设为False并且数据集的大小不能被batch_size整除,则最后一个batch将更小。(default: False) timeout
(numeric, optional) 如果是正数,表明等待从worker进程中收集一个batch等待的时间,若超出设定的时间还没有收集到,那就不收集这个内容了。这个numeric应总是大于等于0。(default: 0) worker_init_fn
(_callable, optional*) 每个worker初始化函数 (default: None)dataset
没什么好说的,很重要,需要按照前面所说的两种dataset定义好,完成相关函数的重写。batch\_size
也没啥好说的,就是训练的一个批次的样本数。shuffle
表示每一个epoch中训练样本的顺序是否相同,一般True。
采样器
sampler 重点参数,采样器,是一个迭代器。PyTorch提供了多种采样器,用户也可以自定义采样器。
所有sampler都是继承 torch.utils.data.sampler.Sampler
这个抽象类。
关于迭代器的基础知识在博主这篇文章中可以找到Python迭代器与生成器介绍及在Pytorch源码中应用。
class Sampler(object):
# """Base class for all Samplers.
# Every Sampler subclass has to provide an __iter__ method, providing a way
# to iterate over indices of dataset elements, and a __len__ method that
# returns the length of the returned iterators.
# """
# 一个 迭代器 基类
def __init__(self, data_source):
pass
def __iter__(self):
raise NotImplementedError
def __len__(self):
raise NotImplementedError
PyTorch 自带的 Sampler
SequentialSampler RandomSampler SubsetRandomSampler WeightedRandomSampler
SequentialSampler 很好理解就是顺序采样器。
其原理是首先在初始化的时候拿到数据集data_source
,之后在__iter__
方法中首先得到一个和data_source
一样长度的range
可迭代器。每次只会返回一个索引值。
class SequentialSampler(Sampler):
# r"""Samples elements sequentially, always in the same order.
# Arguments:
# data_source (Dataset): dataset to sample from
# """
# 产生顺序 迭代器
def __init__(self, data_source):
self.data_source = data_source
def __iter__(self):
return iter(range(len(self.data_source)))
def __len__(self):
return len(self.data_source)
参数作用:
data_source
: 同上num_samples
: 指定采样的数量,默认是所有。replacement
: 若为True,则表示可以重复采样,即同一个样本可以重复采样,这样可能导致有的样本采样不到。所以此时我们可以设置num_samples来增加采样数量使得每个样本都可能被采样到。
class RandomSampler(Sampler):
# r"""Samples elements randomly. If without replacement, then sample from a shuffled dataset.
# If with replacement, then user can specify ``num_samples`` to draw.
# Arguments:
# data_source (Dataset): dataset to sample from
# num_samples (int): number of samples to draw, default=len(dataset)
# replacement (bool): samples are drawn with replacement if ``True``, default=False
# """
def __init__(self, data_source, replacement=False, num_samples=None):
self.data_source = data_source
self.replacement = replacement
self.num_samples = num_samples
if self.num_samples is not None and replacement is False:
raise ValueError("With replacement=False, num_samples should not be specified, "
"since a random permute will be performed.")
if self.num_samples is None:
self.num_samples = len(self.data_source)
if not isinstance(self.num_samples, int) or self.num_samples <= 0:
raise ValueError("num_samples should be a positive integeral "
"value, but got num_samples={}".format(self.num_samples))
if not isinstance(self.replacement, bool):
raise ValueError("replacement should be a boolean value, but got "
"replacement={}".format(self.replacement))
def __iter__(self):
n = len(self.data_source)
if self.replacement:
return iter(torch.randint(high=n, size=(self.num_samples,), dtype=torch.int64).tolist())
return iter(torch.randperm(n).tolist())
def __len__(self):
return len(self.data_source)
这个采样器常见的使用场景是将训练集划分成训练集和验证集:
class SubsetRandomSampler(Sampler):
# r"""Samples elements randomly from a given list of indices, without replacement.
# Arguments:
# indices (sequence): a sequence of indices
# """
def __init__(self, indices):
self.indices = indices
def __iter__(self):
return (self.indices[i] for i in torch.randperm(len(self.indices)))
def __len__(self):
return len(self.indices)
batch_sampler
前面的采样器每次都只返回一个索引,但是我们在训练时是对批量的数据进行训练,而这个工作就需要BatchSampler
来做。也就是说BatchSampler
的作用就是将前面的Sampler采样得到的索引值进行合并,当数量等于一个batch大小后就将这一批的索引值返回。
class BatchSampler(Sampler):
# Wraps another sampler to yield a mini-batch of indices.
# Args:
# sampler (Sampler): Base sampler.
# batch_size (int): Size of mini-batch.
# drop_last (bool): If ``True``, the sampler will drop the last batch if
# its size would be less than ``batch_size``
# Example:
# >>> list(BatchSampler(SequentialSampler(range(10)), batch_size=3, drop_last=False))
# [[0, 1, 2], [3, 4, 5], [6, 7, 8], [9]]
# >>> list(BatchSampler(SequentialSampler(range(10)), batch_size=3, drop_last=True))
# [[0, 1, 2], [3, 4, 5], [6, 7, 8]]
# 批次采样
def __init__(self, sampler, batch_size, drop_last):
if not isinstance(sampler, Sampler):
raise ValueError("sampler should be an instance of "
"torch.utils.data.Sampler, but got sampler={}"
.format(sampler))
if not isinstance(batch_size, _int_classes) or isinstance(batch_size, bool) or \
batch_size <= 0:
raise ValueError("batch_size should be a positive integeral value, "
"but got batch_size={}".format(batch_size))
if not isinstance(drop_last, bool):
raise ValueError("drop_last should be a boolean value, but got "
"drop_last={}".format(drop_last))
self.sampler = sampler
self.batch_size = batch_size
self.drop_last = drop_last
def __iter__(self):
batch = []
for idx in self.sampler:
batch.append(idx)
if len(batch) == self.batch_size:
yield batch
batch = []
if len(batch) > 0 and not self.drop_last:
yield batch
def __len__(self):
if self.drop_last:
return len(self.sampler) // self.batch_size
else:
return (len(self.sampler) + self.batch_size - 1) // self.batch_size
多线程
num_workers
参数表示同时参与数据读取的线程数量,多线程技术可以加快数据读取,提供GPU CPU利用率。
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