有哪些好用的个人项目管理软件？

从项目管理的角度来说，项目分为规划，启动，执行，监控，收尾共五个阶段，个人的项目管理也是包含这些阶段（假设我们都是理性人，所以不需要启动仪式之类）。所以可以改为这样的阶段：规划，执行，监控，总结。

从题主目前的问题来说，可以说在个人管理方面想的比较完全了，而目前确实没有一个工具符合这个全部需求（我想可能是因为目前需要的人太少吧）。从我个人的角度的建议是两个：

建议一，尝试用GTD的方法简化这个流程。我目前的做法是用wunderlist来做GTD, 收集篮就是收件箱，有什么想法，有什么要做的分别放进去。然后设计一个“马上做”，“待会儿在做”，“未来做‘和”别人做’列表。列表可以做很多，可以按项目分或者时段分都行。
GTD的好处不言自明，就是简单。其实题主的这些想法很好，但是实施起来如果很复杂，我个人的经验是，没做多久就放弃了。所以建议一开始可以简化，等有了需求再慢慢增补。

建议二，通过在线工具，比如trello/targetprocess等来做规划。具体方法其实也是列表，不过可视化更好（看板方法）具体可以参考看板管理_百度百科
[ASP.net教程]使用trello管理你的项目

综上，项目管理的方法论很多，主要有瀑布理论(waterfall)，敏捷（agile），增量理论等。一开始不要被理论吓坏，慢慢选择和尝试最佳的实践。由浅入深，循序渐进找到自己最合适的方法。这里先抛个砖，等大神补充。