pystan贝叶斯推理的软件包
PyStan 为 Stan 提供了一个 Python 接口，这是一个使用 No-U-Turn 采样器进行贝叶斯推理的软件包，这是Hamiltonian Monte Carlo 的一种变体。
PyStan具有以下依赖项：
Python：2.7，> = 3.3
Cython：> = 0.22
NumPy：> = 1.7
PyStan还要求在安装和运行时可以使用C ++编译器。 在基于Debian的系统上，这是通过发出命令apt-get install build-essential来完成的。
例子：
import pystan
schools_code = """
data {
int<lower=0> J; // number of schools
vector[J] y; // estimated treatment effects
vector<lower=0>[J] sigma; // s.e. of effect estimates
}
parameters {
real mu;
real<lower=0> tau;
vector[J] eta;
}
transformed parameters {
vector[J] theta;
theta = mu + tau * eta;
}
model {
eta ~ normal(0, 1);
y ~ normal(theta, sigma);
}
"""
schools_dat = {'J': 8,
'y': [28, 8, -3, 7, -1, 1, 18, 12],
'sigma': [15, 10, 16, 11, 9, 11, 10, 18]}
sm = pystan.StanModel(model_code=schools_code)
fit = sm.sampling(data=schools_dat, iter=1000, chains=4)
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