精选| 2020年8月R新包推荐(第45期)
生物信息学习的正确姿势
NGS系列文章包括NGS基础、在线绘图、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程)、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step))、批次效应处理等内容。
作者:Joseph Rickert
2020年8月份,146个R新包收录于CRAN(2020年7月份收录161个),累计收录17,203个R包!由于CRAN会不定时进行R包增删,所以具体数量会随时间略有变化。
此次整理了11个类别,分别为计算方法(3)、数据(2)、基因组学(2)、保险业(1)、机器学习(2)、应用数学(5)、医药学(3)、统计学(9)、时间序列(4)、效率工具(3)和可视化(6)。
二. 数据
三. 基因组学
四. 保险业
五. 机器学习
六. 应用数学
七. 医药学
八. 统计学
3. cyclomort: 支持使用周期性危险函数进行生存建模.
9. tTOlr: 实现一个和两个样本t检验的似然比统计.
九. 时间序列
十. 效率工具
1. DataEditR: 实现一个交互式编辑器,允许在R中交互式地查看、输入和编辑数据.
3. starschemar: 提供从平面表获取星型模式的函数.
十一. 数据可视化
说明:限于个人水平,错误之处难免,烦请批评指正,共同交流~
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