做生物科研,必须了解的高效学术工具!

生信宝典

共 2418字,需浏览 5分钟

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2020-12-11 01:17

一不留神又到期末了,热搜上都在数着哪个学校的寒假更长,而我只想问,科研人的头发还好吗

反正我是恨不得克隆十个自己,一个泡在实验室盯实验结果,一个去盯基金申请,一个去写月底要送审的稿子.....

还有另外七个“我”,这学期的六七篇论文还没搞定,转眼毕业论文又要开题了,好像加上一个“本我”,刚刚够用,我可真是个数学天才!

可现实是只有一个我,只能天天熬夜。

好不容易趁着”努力学习“的时候想在朋友圈矫情一次,结果发错分组还被长辈质疑,“至于吗,不就写个作业?”


好家伙,整得我都开始反问自己,是不是只有我的期末这么兵荒马乱?



其实,期末最头疼的不是事情多,是那些没有任何操作性可言的「重复劳动」。

一整天下来,全在找梯子、找文献、找前沿成果,然后还要打包下载,有的PDF格式的文档想做个笔记做着做着都不知道自己看到哪儿了......

等到自己要开始写了,已经晚上十一点了,脑子里根本没有什么学术观点,可是不写又不行,只能开始东拼西凑,生产一堆学术垃圾。

可是我同门有一个师姐,也就比我早一年,可她今年都发了三篇CSSCI了 !

导师有时候在群里想让我们帮忙查一些冷门文献,每次也都是师姐最快找到。

同样是搞学术,师姐每天看上去都特别轻松,甚至每周还有空去看(谈)话(恋)剧(爱)。

于是我忍不住去请教她是怎么做到的。

“资料和文献那么多,你都靠自己手动找,能不慢吗?”

说完,师姐就给我演示了她是怎么查文献和找资料的,原来她都是用Python自动完成的!

本来还不太了解,但看完师姐的演示后,我惊掉了下巴:

下载文献


最让人头疼的文献,用Python 3秒就能定位,5分钟一并下载相关领域的关键文章、重要作者和科研热点,追溯引证关系。



处理数据 


实验数据自动整合成列表,便于查看筛选;还能自动清洗,一键剔除用不到的。


可视化图表 


Python能把数据自动输出成折线图、三维图、直方图、嵌套饼图等规范高质量的图表,直观展示千辛万苦得来的研究成果,助力文章发表。


难怪师姐期末气色还这么好,有了这个神器根本就不用熬夜吧!

要是大家都知道用这个查文献、做数据,写论文时也不至于这么煎熬了!

于是,我向师姐打听了一下她为什么会知道Python能够用来做学术,编程一向不都是程序员的看家本领吗?

她说,她是在参加某次中科院组织的论坛时,听了有关于Python的讲座,发现它功能强大,然后开始学习的。

不查不知道,一查吓一跳。中科院早已开始在科研领域普及Python了:

中科院官网信息

18年诺贝尔经济学奖的得主Paul Romer,这位经济学领域的专家,也是Python编程语言的忠实粉丝。

经济学研究会涉及到大量的数学运算和统计,而Python是最适合数据科学和统计学领域中的语言。
 
看来,Python真的已经是新时代科研的趋势了,不会Python的科研人,可能连领域前沿成果里的数据模型都搞不清楚了。



你会发现,大多数科研人一旦踏入科研领域,就开始怨天怨地。

实验固然枯燥,文献当然也难啃,但最痛苦的是你大把的时间都花费在了打杂上。

如果这些杂事都不用自己处理,科研人就能够全身心的投入到学术研究中。

所有的科研人都会想要这样一个“信息”助理?

  • 爬取全网公开资料,找到有效信息,让论文不再空洞
  • 对实验结果进行数据分析,让报告更加科学严谨
  • 批量处理Excel&Word&PDF文件,不再怕软件崩溃
  • 生成可视化图表,成果展示更加直观,答辩不再卡壳

这不需要有科研界的海螺姑娘,只需要几行代码,Python就都能帮你实现。

△几千条论文几秒钟瞬间抓取

工欲善其事,必先利其器。大数据时代,科研人想要如鱼得水,学会Python应当提上日程。

这也是我想把风变编程-Python小课推荐给大家的原因。它家做的是针对小白的Python课程,不用看视频,每天抽出半小时,4天0基础就能入门。

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01

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学习的进度自动保存,如果有急事离开,随时回来打开就能继续学习。也可以反复学习哦。


02

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△“打印皮卡丘”编程练习

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03

不用安装任何软件


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△10秒进入编程页面


04

不懂就问助教,教到会为止


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