一起感受基因的力量吧!
相信很多朋友和小编一样,是听着 “小燕子 穿花衣 年年春天来这里”的儿歌长大的。妈妈总是告诉我们,燕子来了,春天就到了。
各种各样的鸟儿们在给这个世界带来更多的灵动与色彩的同时也被文化了赋予了不同的寓意:象征着忠贞爱情的鸳鸯、代表着刚劲自由的雄鹰、寄托着思念感伤的大雁…
但你能想象 鸟儿们的祖先
或许是传统印象中凶猛强壮的恐龙先生吗?
1868 年,英国科学家托马斯·赫胥黎首次提出了「鸟类恐龙起源假说」,百年来,各种化石遗骸的出土陆续为这一猜想提供了有力证据,这一场“恐龙变鸟记”令人惊叹。
生物的演化神奇又复杂,每个物种都是经过数百万年的演化才变成了现在的模样。本期超级云讲堂季妍竹老师带你走进“BLAST”在分子演化生物学中的应用,一起感受基因的力量吧!
超级云讲堂 X 科萤书院
2022年第四讲
BLAST在分子演化生物学中的应用
6月10日晚上20:00-21:00
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季妍竹,博士后 中国科学院动物研究所 动物进化与系统学重点实验室。
主要研究方向为转座子的分子演化、鸟类基因组演化等,主要结合perl、Linux命令行和R等,利用各种生物信息软件搭建分析流程,完成过多种生物信息分析,如转座子在非模式生物基因组中的鉴定、转录组的组装和表达、基因组重组率分析、统计分析等。和BLAST相关的分析包括同源转座子、微卫星序列的鉴定等。
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讲师导语
分子演化生物学相关研究中,常常遇到需要寻找已知序列的同源序列的问题,如判断某引物是否覆盖目标区域、或在数据库中寻找某基因的同源基因等。Basic Local Alignment Search Tool (BLAST)是Altschul等人1990年发表的方法,是解决此类问题的重要方法之一。本讲座将结合实例,从BLAST的基本原理出发,着重介绍BLAST的一些重要参数(如E值、word size等),以及它们如何影响数据库搜素的结果。
报告目录:
BLAST的基本原理
BLAST的重要参数
BLAST的应用实例
「科萤书院」是一个聚焦生态环境研究领域,致力于营造良好“作者-审稿人-编辑”期刊生态链、融通“期刊-专业读者-大众读者”知识传递链的学术性公益组织。“科萤书院”由E方知库与Bulletin of Environmental Contamination and Toxicology (BECT)期刊亚洲编辑部于2021年4月共同发起。“科萤书院”将通过举行线上及线下的科技论文写作思维与技巧培训、审稿人技能与经验分享,将最实用的写作知识与久经沙场的审稿经验传递给小白作者与年轻审稿人。科萤书院将开设系列讲座,针对科技论文写作与发表过程中面临的不解与困惑,推出相关主题的金牌讲师,开展快速、高效的快闪讲授。同时, 建立“作者-审稿人-编辑”沟通联系群为您答疑解惑。
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