东南大学陆祖宏团队成功解析首批染色体水平的高质量石珊瑚基因组图谱
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· 2024-04-02
珊瑚礁由于全球气候变化而面临着前所未有的威胁,这些气候变化包括海温上升、海洋酸化和污染等。保护石珊瑚及其所处的环境对海洋生态系统的健康和多样性至关重要。近年来,虽然关于石珊瑚转录组和基因组的研究已有报道,但石珊瑚的独特性质对其基因组组装提出了挑战,高度杂合性和外源序列污染阻碍了高质量石珊瑚基因组的组装。例如,细胞内共生藻科、环境共生藻类和微生物伴随石珊瑚的整个生命周期,因此,去除序列污染是石珊瑚基因组组装中不可或缺的步骤。
近日,东南大学陆祖宏团队在预印本平台Research Square发表了题为“Deciphering omics atlases to aid stony corals in response to global change”的文章。研究团队利用新的工作流程,解决了珊瑚基因组组装中的难点问题,并完成了全球首批染色体水平高质量石珊瑚基因组的测序和组装。同时,研究团队还深化了领域内对石珊瑚成钙、共生以及基因组保守性和整体演化的认识。
主要研究内容
图3. 石珊瑚SIDT1及其跨膜转运miRNA前体的功能
结 语
论文原文:
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