用Pandas做数据清洗,我一般都这么干……【文末送书】

小数志

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2020-12-04 10:56


导读

作为一名数据分析师,每天都在完成各种数据分析需求,其中数据清洗是必不可少的一个步骤。一般而言,当提及数据清洗时,其实是主要包括了缺失值处理、重复值处理和异常值处理三类操作,本文即围绕这这三个方面介绍一下个人的一些习惯操作。


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01 缺失值处理

缺失值是各类数据集中经常会遇到的情形,相较于工整完全的数据记录,带有一定的缺失值更接近于数据的真实原貌。一般而言,缺失值处理的原则无非就是以下三种:

  • 缺失比例较小,可直接过滤掉缺失值所在行

  • 缺失比例较大,根据特定的业务理解进行一定规则的填充

  • 缺失记录有特定业务含义,不做任何处理


至于在实际数据分析中应该采取哪种方案来处理,这个要结合具体的数据分析场景和业务需求,不可一概而论。所以,这里仅给出基于Pandas的具体处理方法。


1. 过滤掉缺失值所在行
在过滤之前,首先要分析缺失比例的大小,其基础在于判断各个值是否为空,pandas提供了4个相关API,包括

  • isna(), isnull(),二者等价

  • notna(), notnull(),二者等价


这四个函数用法也非常显然了,前两个用于判断各元素是否为空,后两个则用于判断各元素是否非空。4个函数返回值元素类型均为Boolean值,所以可进一步嵌套一层mean()函数直接计算缺失比例。例如:


在完成缺失值比例分析的基础上,断定可以直接过滤掉缺失值,那么仅需执行如下操作即可:


2. 对缺失值进行填充

有些情况下,对缺失值直接进行过滤会导致样本分布受到影响。同时基于特定的业务理解,可以采取一定的规则进行填充,一般而言填充的方式包括两大类:特定值和特定规则。缺失值的填充API主要是用fillna(),当然也可手动用缺失值筛选+赋值的形式完成这一操作。


  • 特定值填充。特定值填充一般是对缺失的位置填充某种特定值,当然这里的特定值一般又可细分为3种情况:常数,均值,众数,其中均值填充主要适用于取值连续的情形,而众数填充则适用于取值离散的情形,常数值填充则是基于特定的业务含义。举个例子:


  • 特定规则填充。在某些不适合利用常数值填充的情况下时,基于特定场景可基于特定规则填充,例如得到疫情期间各地累计感染人数,当某地某天的感染人数最新数字缺失时,我们可以用其前一天的感染人数填充。这实际上就是前向填充,类似地还有后向填充。再比如,获取一天各时刻的温度值,当某一时刻温度数据缺失时,那么实际上可基于前后记录拟合插值的方式填充。



02 重复值处理

与缺失值一样,重复值也是数据分析中经常遇到的一种情形,一般是由于样本重复记录或重复读取造成。当然,根据特定的分析场景和业务需求,对于重复值的处理实际上也包含两种情况:

  • 对重复值进行过滤

  • 重复值存在合理性,不做处理


这里仅给出需过滤重复值时的处理方法。既然要过滤掉重复值,那么首先要判断哪些是重复值,pandas中提供接口为duplicated(),具体如下:


类似地,执行重复值过滤的接口为drop_duplicates(),仍然可选keep参数保留不同不同的重复记录:


另外,在某些情况下不需要针对所有列进行重复值判断,而是仅在特定几列范围内展开去重,此时drop_duplicates还可选一个参数subset,接收列名序列。



03 异常值处理

不同于缺失值和重复值那样规则相对明朗,异常值的处理相对更为复杂。首先要基于业务理解出什么情况下算作是异常值,其次还要指定异常值的处理规则,要么是对异常值所在记录进行过滤,要么是按照一定的规则进行转换,使得异常值变为"正常值"。


就个人目前所应用到数据处理而言,常用的异常值判断规则包括如下几类:
  • 基于数值范围,对于取值连续的情形,可判断数值的绝对大小是否在合理范围,分布是否在箱线图之间,例如车速的大小一般可用[0, 120]作为合理区间进行判断;对于取值离散的情形,可判断取值是否在指定的候选集之间,例如性别的取值范围可能包括男、女和未知三种。

  • 基于特定业务含义,例如每条记录中的两个字段对应了明确的大小或先后关系,当不满足这一关系时可判断为异常值。例如城市抓拍过车记录中,对于一条包括出发时间和到达时间的车辆行驶记录,当到达时间小于等于出发时间时,或者到达时间与出发时间的时间差小于某个阈值时,都可以认为是异常记录

  • 基于特定业务含义,单条记录并无异常,但放在整个数据集中则是异常记录。例如仍以城市抓拍车辆出行为例,虽然从单条记录来看并无异常之处,但对于整个数据集来看,某车牌号在全天仅出现1次,那么相较于该车牌号确实仅出现1次而言,认为该记录中的车牌号识别错误的可能性更为合理,因为该条记录也应认为是异常记录。


这里以某真实GPS数据集为例,原始数据集如下:


以上述三种异常值的清洗需求为例,其执行流程分别如下:
1. 清洗单字段取值异常的记录

以速度字段为例,首先判断其取值分布情况:

绘图接口:seaborn.boxenplot()


显然,无论是从箱线图来看,还是从绝对取值来看,都有一部分速度值异常的记录,为了过滤掉这些记录,可直接用query()实现,query的具体用法可参考历史文章Pandas用了一年,这3个函数是我的最爱……


2. 根据记录内部条件过滤异常值
这里,我们暂时脱离GPS数据中的具体含义,假设给定规则为run_status≥status,否则视为异常记录,那么执行这一过程的方法为:


更一般地,要求run_status-status>=1,则可用如下方法实现:


3. 基于整个数据集进行整体判断

在以上数据集中,假定device_no对应了唯一GPS终端信息,现在要求各终端在整个数据集中要求至少出现10次,否则认为其为异常记录,例如某device_no在整个数据集中仅出现了9次,那么认为这9条记录均为异常记录而需要清洗。实现方法也有很多,但借助groupby+transform可轻松实现这一清洗过程:


对groupby的各种操作不熟悉的,可参考历史文章Pandas中groupby的这些用法你都知道吗?



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内容简介:

本书基于Python3.7版本软件编写,全书主要围绕整个数据分析方法论的标准流程,为读者重点展示了Python在数据获取、数据处理、数据探索、数据分析及数据可视化等领域的应用技术。

本书首先介绍了数据分析的方法论,给读者介绍了具体的数据分析挖掘标准流程,接着介绍了Python常用的工具包,包括科学计算库NumPy、数据分析库Pandas、数据挖掘库Scikit-Learn,以及数据可视化库Matplotlib和Seaborn的基本知识,并从数据分析挖掘过程中的数据获取、数据处理、数据探索等实际业务应用出发,以互联网、金融及零售等行业真实案例,比如客户分群、产品精准营销、房价预测、特征降维等,深入浅出、循序渐进地介绍Python数据分析的全过程。 


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