那些功能逆天,却鲜为人知的pandas骚操作

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2020-03-24 23:25


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文章来源:Python数据科学

作者:东哥

阅读文本大概需要 6 分钟


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pandas有些功能很逆天,但却鲜为人知,本篇给大家盘点一下。


一、ACCESSOR


pandas有一种功能非常强大的方法,它就是accessor,可以将它理解为一种属性接口,通过它可以获得额外的方法。其实这样说还是很笼统,下面我们通过代码和实例来理解一下。


>>> pd.Series._accessors
{'cat''str''dt'}

对于Series数据结构使用_accessors方法,可以得到了3个对象:cat,str,dt。

  • .cat:用于分类数据(Categorical data)

  • .str用于字符数据(String Object data)

  • .dt用于时间数据(datetime-like data)


下面我们依次看一下这三个对象是如何使用的。


str对象的使用


Series数据类型:str字符串


# 定义一个Series序列
>>> addr = pd.Series([
...     'Washington, D.C. 20003',
...     'Brooklyn, NY 11211-1755',
...     'Omaha, NE 68154',
...     'Pittsburgh, PA 15211'
... ]) 

>>> addr.str.upper()
0     WASHINGTON, D.C. 20003
1    BROOKLYN, NY 11211-1755
2            OMAHA, NE 68154
3       PITTSBURGH, PA 15211
dtype: object

>>> addr.str.count(r'\d'
0    5
1    9
2    5
3    5
dtype: int64


关于以上str对象的2个方法说明:

  • Series.str.upper:将Series中所有字符串变为大写

  • Series.str.count对Series中所有字符串的个数进行计数


其实不难发现,该用法的使用与Python中字符串的操作很相似。没错,在pandas中你一样可以这样简单的操作,而不同的是你操作的是一整列的字符串数据。仍然基于以上数据集,再看它的另一个操作:


>>> regex = (r'(?P[A-Za-z ]+), '      # 一个或更多字母
...          r'(?P[A-Z]{2}) '        # 两个大写字母
...          r'(?P\d{5}(?:-\d{4})?)')  # 可选的4个延伸数字
...
>>> addr.str.replace('.''').str.extract(regex)
         city state         zip
0  Washington    DC       20003
1    Brooklyn    NY  11211-1755
2       Omaha    NE       68154
3  Pittsburgh    PA       15211


关于以上str对象的2个方法说明:

  • Series.str.replace:将Series中指定字符串替换
  • Series.str.extract:通过正则表达式提取字符串中的数据信息


这个用法就有点复杂了,因为很明显看到,这是一个链式的用法。通过replace将 " . " 替换为"",即为空紧接着又使用了3个正则表达式(分别对应city,state,zip)通过extract对数据进行了提取并由原来的Series数据结构变为了DataFrame数据结构。


当然,除了以上用法外,常用的属性和方法还有.rstrip,.contains,split等,我们通过下面代码查看一下str属性的完整列表:


>>> [i for i in dir(pd.Series.str) if not i.startswith('_')]
['capitalize',
 'cat',
 'center',
 'contains',
 'count',
 'decode',
 'encode',
 'endswith',
 'extract',
 'extractall',
 'find',
 'findall',
 'get',
 'get_dummies',
 'index',
 'isalnum',
 'isalpha',
 'isdecimal',
 'isdigit',
 'islower',
 'isnumeric',
 'isspace',
 'istitle',
 'isupper',
 'join',
 'len',
 'ljust',
 'lower',
 'lstrip',
 'match',
 'normalize',
 'pad',
 'partition',
 'repeat',
 'replace',
 'rfind',
 'rindex',
 'rjust',
 'rpartition',
 'rsplit',
 'rstrip',
 'slice',
 'slice_replace',
 'split',
 'startswith',
 'strip',
 'swapcase',
 'title',
 'translate',
 'upper',
 'wrap',
 'zfill']


属性有很多,对于具体的用法,如果感兴趣可以自己进行摸索练习。


dt对象的使用


Series数据类型:datetime


因为数据需要datetime类型,所以下面使用pandas的date_range()生成了一组日期datetime演示如何进行dt对象操作。


>>> daterng = pd.Series(pd.date_range('2017', periods=9, freq='Q'))
>>> daterng
0   2017-03-31
1   2017-06-30
2   2017-09-30
3   2017-12-31
4   2018-03-31
5   2018-06-30
6   2018-09-30
7   2018-12-31
8   2019-03-31
dtype: datetime64[ns]

>>>  daterng.dt.day_name()
0      Friday
1      Friday
2    Saturday
3      Sunday
4    Saturday
5    Saturday
6      Sunday
7      Monday
8      Sunday
dtype: object

>>> # 查看下半年
>>> daterng[daterng.dt.quarter > 2]
2   2017-09-30
3   2017-12-31
6   2018-09-30
7   2018-12-31
dtype: datetime64[ns]

>>> daterng[daterng.dt.is_year_end]
3   2017-12-31
7   2018-12-31
dtype: datetime64[ns]


以上关于dt的3种方法说明:

  • Series.dt.day_name():从日期判断出所处星期数
  • Series.dt.quarter:从日期判断所处季节
  • Series.dt.is_year_end:从日期判断是否处在年底

其它方法也都是基于datetime的一些变换,并通过变换来查看具体微观或者宏观日期。


cat对象的使用


Series数据类型:Category


在说cat对象的使用前,先说一下Category这个数据类型,它的作用很强大。虽然我们没有经常性的在内存中运行上g的数据,但是我们也总会遇到执行几行代码会等待很久的情况。使用Category数据的一个好处就是:可以很好的节省在时间和空间的消耗。下面我们通过几个实例来学习一下。


>>> colors = pd.Series([
...     'periwinkle',
...     'mint green',
...     'burnt orange',
...     'periwinkle',
...     'burnt orange',
...     'rose',
...     'rose',
...     'mint green',
...     'rose',
...     'navy'
... ])
...
>>> import sys
>>> colors.apply(sys.getsizeof)
0    59
1    59
2    61
3    59
4    61
5    53
6    53
7    59
8    53
9    53
dtype: int64


上面我们通过使用sys.getsizeof来显示内存占用的情况,数字代表字节数。还有另一种计算内容占用的方法:memory_usage(),后面会使用。


现在我们将上面colors的不重复值映射为一组整数,然后再看一下占用的内存。


>>> mapper = {v: k for k, v in enumerate(colors.unique())}
>>> mapper
{'periwinkle'0'mint green'1'burnt orange'2'rose'3'navy'4}

>>> as_int = colors.map(mapper)
>>> as_int
0    0
1    1
2    2
3    0
4    2
5    3
6    3
7    1
8    3
9    4
dtype: int64

>>> as_int.apply(sys.getsizeof)
0    24
1    28
2    28
3    24
4    28
5    28
6    28
7    28
8    28
9    28
dtype: int64


注:对于以上的整数值映射也可以使用更简单的pd.factorize()方法代替。


我们发现上面所占用的内存是使用object类型时的一半。其实,这种情况就类似于Category data类型内部的原理。


内存占用区别:Categorical所占用的内存与Categorical分类的数量和数据的长度成正比,相反,object所占用的内存则是一个常数乘以数据的长度。


下面是object内存使用和category内存使用的情况对比。


>>> colors.memory_usage(index=False, deep=True)
650
>>> colors.astype('category').memory_usage(index=False, deep=True)
495


上面结果是使用objectCategory两种情况下内存的占用情况。我们发现效果并没有我们想象中的那么好。但是注意Category内存是成比例的,如果数据集的数据量很大,但不重复分类(unique)值很少的情况下,那么Category的内存占用可以节省达到10倍以上,比如下面数据量增大的情况:


>>> manycolors = colors.repeat(10)
>>> len(manycolors) / manycolors.nunique() 
20.0

>>> manycolors.memory_usage(index=False, deep=True)
6500
>>> manycolors.astype('category').memory_usage(index=False, deep=True)
585


可以看到,在数据量增加10倍以后,使用Category所占内容节省了10倍以上。


除了占用内存节省外,另一个额外的好处是计算效率有了很大的提升。因为对于Category类型的Series,str字符的操作发生在.cat.categories的非重复值上,而并非原Series上的所有元素上。也就是说对于每个非重复值都只做一次操作,然后再向与非重复值同类的值映射过去。


对于Category的数据类型,可以使用accessor的cat对象,以及相应的属性和方法来操作Category数据。


>>> ccolors = colors.astype('category')
>>> ccolors.cat.categories
Index(['burnt orange''mint green''navy''periwinkle''rose'], dtype='object')


实际上,对于开始的整数类型映射,可以先通过reorder_categories进行重新排序,然后再使用cat.codes来实现对整数的映射,来达到同样的效果。


>>> ccolors.cat.reorder_categories(mapper).cat.codes
0    0
1    1
2    2
3    0
4    2
5    3
6    3
7    1
8    3
9    4
dtype: int8


dtype类型是Numpy的int8(-127~128)。可以看出以上只需要一个单字节就可以在内存中包含所有的值。我们开始的做法默认使用了int64类型,然而通过pandas的使用可以很智能的将Category数据类型变为最小的类型。


让我们来看一下cat还有什么其它的属性和方法可以使用。下面cat的这些属性基本都是关于查看和操作Category数据类型的。


>>> [i for i in dir(ccolors.cat) if not i.startswith('_')]
['add_categories',
 'as_ordered',
 'as_unordered',
 'categories',
 'codes',
 'ordered',
 'remove_categories',
 'remove_unused_categories',
 'rename_categories',
 'reorder_categories',
 'set_categories']


但是Category数据的使用不是很灵活。例如,插入一个之前没有的值,首先需要将这个值添加到.categories的容器中,然后再添加值。


>>> ccolors.iloc[5] = 'a new color'
# ...
ValueError: Cannot setitem on a Categorical with a new category,
set the categories first

>>> ccolors = ccolors.cat.add_categories(['a new color'])
>>> ccolors.iloc[5] = 'a new color'  


如果你想设置值或重塑数据,而非进行新的运算操作,那么Category类型不是那么有用。


二、从clipboard剪切板载入数据


当我们的数据存在excel表里,或者其它的IDE编辑器中的时候,我们想要通过pandas载入数据。我们通常的做法是先保存再载入,其实这样做起来十分繁琐。一个简单的方法就是使用pd.read_clipboard() 直接从电脑的剪切板缓存区中提取数据。

这样我们就可以直接将结构数据转变为DataFrame或者Series了。excel表中数据是这样的:
6db2512420527b56a353494dc4b3fa7a.webp
在纯文本文件中,比如txt文件,是这样的:
a   b           c       d
0   1           inf     1/1/00
2   7.389056099 N/A     5-Jan-13
4   54.59815003 nan     7/24/18
6   403.4287935 None    NaT

将上面excel或者txt中的数据选中然后复制,然后使用pandas的read_clipboard()即可完成到DataFrame的转换。parse_dates参数设置为 "d",可以自动识别日期,并调整为xxxx-xx-xx的格式。
>>> df = pd.read_clipboard(na_values=[None], parse_dates=['d'])
>>> df
   a         b    c          d
0  0    1.0000  inf 2000-01-01
1  2    7.3891  NaN 2013-01-05
2  4   54.5982  NaN 2018-07-24
3  6  403.4288  NaN        NaT

>>> df.dtypes
a             int64
b           float64
c           float64
d    datetime64[ns]
dtype: object


三、将pandas对象转换为“压缩”格式


在pandas中,我们可以直接将objects打包成为 gzip, bz2, zip, or xz 等压缩格式,而不必将没压缩的文件放在内存中然后进行转化。来看一个例子如何使用:
>>> abalone = pd.read_csv(url, usecols=[012348], names=cols)

>>> abalone
     sex  length   diam  height  weight  rings
0      M   0.455  0.365   0.095  0.5140     15
1      M   0.350  0.265   0.090  0.2255      7
2      F   0.530  0.420   0.135  0.6770      9
3      M   0.440  0.365   0.125  0.5160     10
4      I   0.330  0.255   0.080  0.2050      7
5      I   0.425  0.300   0.095  0.3515      8
6      F   0.530  0.415   0.150  0.7775     20
...   ..     ...    ...     ...     ...    ...
4170   M   0.550  0.430   0.130  0.8395     10
4171   M   0.560  0.430   0.155  0.8675      8
4172   F   0.565  0.450   0.165  0.8870     11
4173   M   0.590  0.440   0.135  0.9660     10
4174   M   0.600  0.475   0.205  1.1760      9
4175   F   0.625  0.485   0.150  1.0945     10
4176   M   0.710  0.555   0.195  1.9485     12

导入文件,读取并存为abalone(DataFrame结构)。当我们要存为压缩的时候,简单的使用 to_json() 即可轻松完成转化过程。下面通过设置相应参数将abalone存为了.gz格式的压缩文件。
abalone.to_json('df.json.gz', orient='records',
                lines=True, compression='gzip')

如果我们想知道储存压缩文件的大小,可以通过内置模块os.path,使用getsize方法来查看文件的字节数。下面是两种格式储存文件的大小对比。
>>> import os.path
>>> abalone.to_json('df.json', orient='records', lines=True)
>>> os.path.getsize('df.json') / os.path.getsize('df.json.gz')
11.603035760226396


四、使用"测试模块"制作伪数据


在pandas中,有一个测试模块可以帮助我们生成半真实(伪数据),并进行测试,它就是util.testing。下面同我们通过一个简单的例子看一下如何生成数据测试:
>>> import pandas.util.testing as tm
>>> tm.N, tm.K = 153  # 默认的行和列

>>> import numpy as np
>>> np.random.seed(444)

>>> tm.makeTimeDataFrame(freq='M').head()
                 A       B       C
2000-01-31  0.3574 -0.8804  0.2669
2000-02-29  0.3775  0.1526 -0.4803
2000-03-31  1.3823  0.2503  0.3008
2000-04-30  1.1755  0.0785 -0.1791
2000-05-31 -0.9393 -0.9039  1.1837

>>> tm.makeDataFrame().head()
                 A       B       C
nTLGGTiRHF -0.6228  0.6459  0.1251
WPBRn9jtsR -0.3187 -0.8091  1.1501
7B3wWfvuDA -1.9872 -1.0795  0.2987
yJ0BTjehH1  0.8802  0.7403 -1.2154
0luaYUYvy1 -0.9320  1.2912 -0.2907

上面简单的使用了makeTimeDataFrame 和 makeDataFrame 分别生成了一组时间数据和DataFrame的数据。但这只是其中的两个用法,关于testing中的方法有大概30多个,如果你想全部了解,可以通过查看dir获得:
>>> [i for i in dir(tm) if i.startswith('make')]
['makeBoolIndex',
 'makeCategoricalIndex',
 'makeCustomDataframe',
 'makeCustomIndex',
 # ...,
 'makeTimeSeries',
 'makeTimedeltaIndex',
 'makeUIntIndex',
 'makeUnicodeIndex']


五、从列项中创建DatetimeIndex


也许我们有的时候会遇到这样的情形(为了说明这种情情况,我使用了product进行交叉迭代的创建了一组关于时间的数据):
>>> from itertools import product
>>> datecols = ['year''month''day']

>>> df = pd.DataFrame(list(product([20172016], [12], [123])),
...                   columns=datecols)
>>> df['data'] = np.random.randn(len(df))
>>> df
    year  month  day    data
0   2017      1    1 -0.0767
1   2017      1    2 -1.2798
2   2017      1    3  0.4032
3   2017      2    1  1.2377
4   2017      2    2 -0.2060
5   2017      2    3  0.6187
6   2016      1    1  2.3786
7   2016      1    2 -0.4730
8   2016      1    3 -2.1505
9   2016      2    1 -0.6340
10  2016      2    2  0.7964
11  2016      2    3  0.0005

明显看到,列项中有year,month,day,它们分别在各个列中,而并非是一个完整日期。那么如何从这些列中将它们组合在一起并设置为新的index呢?

通过to_datetime的使用,我们就可以直接将年月日组合为一个完整的日期,然后赋给索引。代码如下:
>>> df.index = pd.to_datetime(df[datecols])
>>> df.head()
            year  month  day    data
2017-01-01  2017      1    1 -0.0767
2017-01-02  2017      1    2 -1.2798
2017-01-03  2017      1    3  0.4032
2017-02-01  2017      2    1  1.2377
2017-02-02  2017      2    2 -0.2060

当然,你可以选择将原有的年月日列移除,只保留data数据列,然后squeeze转换为Series结构。
>>> df = df.drop(datecols, axis=1).squeeze()
>>> df.head()
2017-01-01   -0.0767
2017-01-02   -1.2798
2017-01-03    0.4032
2017-02-01    1.2377
2017-02-02   -0.2060
Name: data, dtype: float64

>>> df.index.dtype_str
'datetime64[ns]





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