百万次使用的高颜值在线绘图平台ImageGP系列教程
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2024-09-07 21:00
在线平台BIC (https://www.bic.ac.cn/BIC/#/, 点击阅读原文或百度搜索皆可访问到)是 ImageGP的重构升级版，重构于2020年初。
该平台采用配置文件快速部署工具、生成结果或结果报告。其绘图和分析基于 R 语言(ImageGP 包, 在早期ImageGP脚本的基础上重新进行了封装， GitHub, Gitee)、Python 语言。
累积使用 70 万余次（15 分钟内的多次使用只算作 1 次计数），引用千次！
左侧导航目前包括：1. Professional plots in seconds; 2. Data transform and extraction; 3. Bioinformatics analysis; 4. Interactive visualization; 5. Resource.
1.1 功能部分
1.1.1 Professional plots in seconds
目前支持 16 种基本图形，包括热图、箱线图、富集分析泡泡图、柱状图、火山图、PcOA 分析、Venn 图、直方图、线图等。每种图根据复杂度不同，有数目不一的可调节参数，可组合出很多复合图形。
1.1.2 Data transform and extraction
常见数据格式转换，如宽矩阵转长矩阵、长矩阵转宽矩阵、合并矩阵、矩阵膨胀等功能。
1.1.3 Bioinformatics analysis
生物信息分析部分包括常见的分析工具如 WGCNA共表达网络分析、LEfSe 特征物种鉴定、Limma 差异基因/物种分析、多序列比对、FASTA 处理、RNA 翻译、正则匹配和空间关系等工具，更多工具也在不断完善中。
1.1.4 Interactive view
这是最近尝试的基于 D3.js 的交互式图系列，目前只有进化树展示和多序列比对展示，后面会陆续更新更多交互式图。
1.1.5 Text and video tutorial
这里包括网站使用帮助、常用教程、经典书籍、网址导航等内容，正在陆续更新中。
Send error logs 再升级，提示信息更明显。遇到报错时直接点击按钮，发送错误信息，我们会对接处理。
（最开始按钮上提示文字是 Send error log，有的用户出错了也不知道点，也有的用户问点了会做什么。想了一下，确实没表达清楚意思，没把自己的完整意思都说出来，直说要发，没说发了之后做什么。这也是常见问题，说话留一半，以后在开发工具时需要注意。）