PyTorch数据Pipeline标准化代码模板-技术圈

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PyTorch作为一款流行深度学习框架其热度大有超越TensorFlow的感觉。根据此前的统计，目前TensorFlow虽然仍然占据着工业界，但PyTorch在视觉和NLP领域的顶级会议上已呈一统之势。

这篇文章笔者将和大家聚焦于PyTorch的自定义数据读取pipeline模板和相关trciks以及如何优化数据读取的pipeline等。我们从PyTorch的数据对象类Dataset开始。Dataset在PyTorch中的模块位于utils.data下。

from torch.utils.data import Dataset

本文将围绕Dataset对象分别从原始模板、torchvision的transforms模块、使用pandas来辅助读取、torch内置数据划分功能和DataLoader来展开阐述。

Dataset原始模板

PyTorch官方为我们提供了自定义数据读取的标准化代码代码模块，作为一个读取框架，我们这里称之为原始模板。其代码结构如下：

from torch.utils.data import Datasetclass CustomDataset(Dataset):    def __init__(self, ...):        # stuff            def __getitem__(self, index):        # stuff        return (img, label)            def __len__(self):        # return examples size        return count

根据这个标准化的代码模板，我们只需要根据自己的数据读取任务，分别往__init__()、__getitem__()和__len__()三个方法里添加读取逻辑即可。作为PyTorch范式下的数据读取以及为了后续的data loader，三个方法缺一不可。其中：

__init__()函数用于初始化数据读取逻辑，比如读取包含标签和图片地址的csv文件、定义transform组合等。
__getitem__()函数用来返回数据和标签。目的上是为了能够被后续的dataloader所调用。
__len__()函数则用于返回样本数量。

现在我们往这个框架里填几行代码来形成一个简单的数字案例。创建一个从1到100的数字例子：

from torch.utils.data import Datasetclass CustomDataset(Dataset):    def __init__(self):        self.samples = list(range(1, 101))    def __len__(self):        return len(self.samples)    def __getitem__(self, idx):        return self.samples[idx]        if __name__ == '__main__':    dataset = CustomDataset()    print(len(dataset))    print(dataset[50])    print(dataset[1:100])

添加torchvision.transforms

然后我们来看如何从内存中读取数据以及如何在读取过程中嵌入torchvision中的transforms功能。torchvision是一个独立于torch的关于数据、模型和一些图像增强操作的辅助库。主要包括datasets默认数据集模块、models经典模型模块、transforms图像增强模块以及utils模块等。在使用torch读取数据的时候，一般会搭配上transforms模块对数据进行一些处理和增强工作。

添加了tranforms之后的读取模块可以改写为：

from torch.utils.data import Datasetfrom torchvision import transforms as T
class CustomDataset(Dataset):    def __init__(self, ...):        # stuff        ...        # compose the transforms methods        self.transform = T.Compose([T.CenterCrop(100),                                T.ToTensor()])            def __getitem__(self, index):        # stuff        ...        data = # Some data read from a file or image        # execute the transform        data = self.transform(data)          return (img, label)            def __len__(self):        # return examples size        return count        if __name__ == '__main__':    # Call the dataset    custom_dataset = CustomDataset(...)

可以看到，我们使用了Compose方法来把各种数据处理方法聚合到一起进行定义数据转换方法。通常作为初始化方法放在__init__()函数下。我们以猫狗图像数据为例进行说明。

定义数据读取方法如下：

class DogCat(Dataset):        def __init__(self, root, transforms=None, train=True, val=False):        """        get images and execute transforms.        """        self.val = val        imgs = [os.path.join(root, img) for img in os.listdir(root)]        # train: Cats_Dogs/trainset/cat.1.jpg        # val: Cats_Dogs/valset/cat.10004.jpg        imgs = sorted(imgs, key=lambda x: x.split('.')[-2])        self.imgs = imgs                 if transforms is None:            # normalize                  normalize = T.Normalize(mean = [0.485, 0.456, 0.406],                                     std = [0.229, 0.224, 0.225])            # trainset and valset have different data transform             # trainset need data augmentation but valset don't.            # valset
            if self.val:                self.transforms = T.Compose([                    T.Resize(224),                    T.CenterCrop(224),                    T.ToTensor(),                    normalize                ])            # trainset            else:                self.transforms = T.Compose([                    T.Resize(256),                    T.RandomResizedCrop(224),                    T.RandomHorizontalFlip(),                    T.ToTensor(),                    normalize                ])                           def __getitem__(self, index):        """        return data and label        """        img_path = self.imgs[index]        label = 1 if 'dog' in img_path.split('/')[-1] else 0        data = Image.open(img_path)        data = self.transforms(data)        return data, label      def __len__(self):        """        return images size.        """        return len(self.imgs)
if __name__ == "__main__":    train_dataset = DogCat('./Cats_Dogs/trainset/', train=True)    print(len(train_dataset))    print(train_dataset[0])

因为这个数据集已经分好了训练集和验证集，所以在读取和transforms的时候需要进行区分。运行示例如下：

与pandas一起使用

很多时候数据的目录地址和标签都是通过csv文件给出的。如下所示：

此时在数据读取的pipeline中我们需要在__init__()方法中利用pandas把csv文件中包含的图片地址和标签融合进去。相应的数据读取pipeline模板可以改写为：

class CustomDatasetFromCSV(Dataset):    def __init__(self, csv_path):        """        Args:            csv_path (string): path to csv file            transform: pytorch transforms for transforms and tensor conversion        """        # Transforms        self.to_tensor = transforms.ToTensor()        # Read the csv file        self.data_info = pd.read_csv(csv_path, header=None)        # First column contains the image paths        self.image_arr = np.asarray(self.data_info.iloc[:, 0])        # Second column is the labels        self.label_arr = np.asarray(self.data_info.iloc[:, 1])        # Calculate len        self.data_len = len(self.data_info.index)
    def __getitem__(self, index):        # Get image name from the pandas df        single_image_name = self.image_arr[index]        # Open image        img_as_img = Image.open(single_image_name)        # Transform image to tensor        img_as_tensor = self.to_tensor(img_as_img)        # Get label of the image based on the cropped pandas column        single_image_label = self.label_arr[index]        return (img_as_tensor, single_image_label)
    def __len__(self):        return self.data_len
if __name__ == "__main__":    # Call dataset    dataset =  CustomDatasetFromCSV('./labels.csv')

以mnist_label.csv文件为示例：

from torch.utils.data import Datasetfrom torch.utils.data import DataLoaderfrom torchvision import transforms as Tfrom PIL import Imageimport osimport numpy as npimport pandas as pd
class CustomDatasetFromCSV(Dataset):    def __init__(self, csv_path):        """        Args:            csv_path (string): path to csv file                        transform: pytorch transforms for transforms and tensor conversion        """        # Transforms        self.to_tensor = T.ToTensor()        # Read the csv file        self.data_info = pd.read_csv(csv_path, header=None)        # First column contains the image paths        self.image_arr = np.asarray(self.data_info.iloc[:, 0])        # Second column is the labels        self.label_arr = np.asarray(self.data_info.iloc[:, 1])        # Third column is for an operation indicator        self.operation_arr = np.asarray(self.data_info.iloc[:, 2])        # Calculate len        self.data_len = len(self.data_info.index)
    def __getitem__(self, index):        # Get image name from the pandas df        single_image_name = self.image_arr[index]        # Open image        img_as_img = Image.open(single_image_name)        # Check if there is an operation        some_operation = self.operation_arr[index]        # If there is an operation        if some_operation:            # Do some operation on image            # ...            # ...            pass
        # Transform image to tensor        img_as_tensor = self.to_tensor(img_as_img)        # Get label of the image based on the cropped pandas column        single_image_label = self.label_arr[index]        return (img_as_tensor, single_image_label)
    def __len__(self):        return self.data_len
if __name__ == "__main__":    transform = T.Compose([T.ToTensor()])    dataset = CustomDatasetFromCSV('./mnist_labels.csv')    print(len(dataset))    print(dataset[5])

运行示例如下：

训练集验证集划分

一般来说，为了模型训练的稳定，我们需要对数据划分训练集和验证集。torch的Dataset对象也提供了random_split函数作为数据划分工具，且划分结果可直接供后续的DataLoader使用。

以kaggle的花朵数据为例：

from torch.utils.data import DataLoaderfrom torchvision.datasets import ImageFolderfrom torchvision import transforms as Tfrom torch.utils.data import random_split
transform = T.Compose([    T.Resize((224, 224)),    T.RandomHorizontalFlip(),    T.ToTensor() ])
dataset = ImageFolder('./flowers_photos', transform=transform)print(dataset.class_to_idx)
trainset, valset = random_split(dataset,                 [int(len(dataset)*0.7), len(dataset)-int(len(dataset)*0.7)])
trainloader = DataLoader(dataset=trainset, batch_size=32, shuffle=True, num_workers=1)for i, (img, label) in enumerate(trainloader):    img, label = img.numpy(), label.numpy()    print(img, label)
valloader = DataLoader(dataset=valset, batch_size=32, shuffle=True, num_workers=1)for i, (img, label) in enumerate(trainloader):    img, label = img.numpy(), label.numpy()    print(img.shape, label)

这里使用了ImageFolder模块，可以直接读取各标签对应的文件夹，部分运行示例如下：

使用DataLoader

dataset方法写好之后，我们还需要使用DataLoader将其逐个喂给模型。上一节的数据划分我们已经用到了DataLoader函数。从本质上来讲，DataLoader只是调用了__getitem__()方法并按批次返回数据和标签。使用方法如下：

from torch.utils.data import DataLoaderfrom torchvision import transforms as T
if __name__ == "__main__":    # Define transforms    transformations = T.Compose([T.ToTensor()])    # Define custom dataset    dataset = CustomDatasetFromCSV('./labels.csv')    # Define data loader    data_loader = DataLoader(dataset=dataset, batch_size=10, shuffle=True)    for images, labels in data_loader:        # Feed the data to the model

以上就是PyTorch读取数据的Pipeline主要方法和流程。基于Dataset对象的基本框架不变，具体细节可自定义化调整。

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