一次 Spark SQL 性能提升10倍的经历

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共 9106字,需浏览 19分钟

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2021-01-05 12:53

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1. 遇到了啥问题

是酱紫的,简单来说:并发执行 spark job 的时候,并发的提速很不明显。类似于我们内部有一个系统给分析师用,他们写一些 sql,在我们的 spark cluster 上跑。随着分析师越来越多,sql job 也越来越多,等待运行的时间也越来越长,我们就在想怎么把 sql 运行的时间加快一点。我们的整个架构是 spark 1.6.1 on YARN 的,经过分析一些 sql 发现其实大多数分析语句都是比较简单的统计 sql,集群资源也还算多,一条简单的 sql 语句就把整个集群资源的坑占着略显不合适,有点飞机马达装到拖拉机上的赶脚,所以第一步,我们想,支持 spark job 的并行运行。
ok,初步方案有了,我们就做了如下几步改善工作:
首先设置 spark.scheduler.mode 为 FAIR 模式
首先 spark.scheduler.mode 有 FIFOFAIR 两种模式,FIFO 是说提交的job,都是顺序执行的,后提交的 job 一定要等之前提交的 job 完全执行结束后才可以执行;FAIR 是说,如果之前提交的 job 没有用完集群资源的话,后提交的job可以即刻开始运行。关于这点在官方文档上有详细的解释:
其次,我们生成了 10 个 pool,所谓的 pool,可以理解为资源池,或者通道。你可以在提交 job 的时候指定提交到哪个 pool 里面,可以简单的理解为我们把所有的集群资源分成 10 份,然后在提交 job 的时候指定在哪一份资源中运行这个 job。
 最后,我们在提交 job 的时候指定提交到的 pool 名字,只需要在提交 job 之前设置一个 sparkContext 的参数即可: sc.setLocalProperty("spark.scheduler.pool", "your_pool_id")
看似很简单,但能知道上面这些配置的也算是用 spark 比较熟练的人了吧,我迫不及待的测试了一下速度,发现了一个从古至今的大真理:理想很美好,现实很骨干啊。测试下来,发现多个 job 并行运行的时间并没有节省多少。

2. 原因排查

上面把问题说得很清楚了:多 job 并行的时候,运行速度并没有明显提升。但是原理上应该不会如此,只要一个 sql job 不需要全局所有集群资源,理论上来说会有较大提升的。下面是一组简单的数据对比:
虽然看到,并行计算后时间只需要之前的 50%,但是这里需要说明一下,这个数据不够稳定的哦,比如说偶尔会新增 10来秒 这样子的。这里 暂且接受提升 50% 的速度这样一个结论吧
但是,理论上来说,还能提升更多,不满足 50% 的提升效率,我们接着深度解读 spark web ui 上的一些分析数据,尝试找找能否把速度再度提升一下。终于找到了核心原因,下面我就把整个排查的过程详细记录下来:
  • 找一个花费时间较长的 job,进去看看执行的详情,这里我们用 job id 为 796 的这个 job

  • 发现 job 796 有两个 stage,且有 99% 的时间都花在第一个 stage 1590 上了,而且需要注意的是,这个 stage 有 237.6mb 的数据读取,有可能需要经过网络从其他 hdfs 节点读过来,难道跟网络 I/O 有关?继续点进去看看。

  • 进来这个 stage 内部,似乎发现问题所在了,首先我们先关注下图中标记的几个点,可以总结出几个点:

    • 首先,该 stage 内的所有任务在 executor 上真正执行的时间【可以理解为 cpu time】是 2s

    • 其次,该 stage 内任务执行完成的时间是 1.1 m,大概是 66s,可以理解为【wall time】

    • 该 stage 内所有的 task,schedule delay 的时间中位数是 0.5s,最大达到 1s【真正执行的时间也才 2s 哦】

  • 该 stage 内一共有 336 个task

 
到这里,问题根源基本上已经知道了,即 job 796 的大多数时间都被消耗在 stage 1590 的 336 个task 的 secheduler delay 上面了。

3. 如何解决

上面问题几乎已经明确了,现在就该看看肿么解决了。我当时是这样去考虑的:
  • 为什么 scheduler delay 会这么大

因为资源不够,要解决这个问题,似乎唯一的办法就是增加集群资源了。可是哥们,集群是你想加就能加的吗?那可是要砸钱的呀?而且如果公司缺机器的话,想加集群资源也要经过 申请->审批->采购->分配->集群配置 大大小小几个阶段,说不一定等你找到女朋友了都还没搞定啊。
当时想着加资源这个方案短期不可取后,有那么几分钟是觉得有点烧脑的。我就静静的看着 web ui,心里在算,一个 task 如果平均 scheduler delay 0.5s 的话,这 336 个 task 就得 delay 118 秒,基本上都到 2 分钟了。这 delay 的时间可真够长的啊,就在算这个数值的时候,突然想到这样一个公式:total delay time = average delay time * task number。现在我们的问题是要解决 total delay time,那完全可以从两方面去解决呀:
  • 降低 average delay time:目前来看似乎唯一的方法是砸钱加资源

  • 降低 task 数:粗略来看,简单的降低 task 数的话,应该是能减少 total delay time 的,但是如果task 数降低了,意味着每个 task 需要处理的数据量就多了,那其他的时间应该是会增加一些的,比如说 Task Deserialization Time, Result Serialization Time, GC Time, Duration 等。减少 task 数究竟能不能提高整体运行速度,似乎乍一看还真不好确定。

反正砸钱加资源这个方案暂时是行不通的,要不就再仔细分析一下降低task数这个方案。这里我们在仔细参考一下下图中这一列指标:

我们用 75 分位的统计数据来做一个假设:假设我们把每一个 task 的数据量加 10 倍,那么预计的 task metrics 75 分位大概是一个什么样的数值,假设这些指标都是线性增长的话:
  • Duration: 扩大到 10 倍,14ms

  • Scheduler Delay: 这个指标不用估计

  • Task Deserialization Time: 扩大到 10 倍,6ms

  • GC Time: 扩大到 10 倍,最多1ms

  • Result Serialization Time: 扩大到 10 倍,最多1ms

  • Getting Result Time: 扩大到 10 倍,最多1ms

  • Peak Execution Memory: 扩大到 10 倍,最多 1b

  • Input Size / Records: 扩大到 10 倍,918.8 KB * 2 / 2

  • Shuffle Write Size / Records 0: 扩大到 10 倍,294.0 B * 2/ 20

可以看到,这样大概估计下来,除去 Scheduler Delay 的时间,其实其他时间也没消耗多少,都是毫秒级的,看起来应该是完全可行的呀。
正准备这样测试的时候,我忽然想到,为什么现在的 metrics 统计是这样的结构的啊,这么多 task?一般来说,一个 task 对应到 hdfs 上的一个 parquet 文件【该项目中所有数据文件都是用 parquet 压缩后存储到 hdfs 上的】,难道是现在存在 hdfs 上的 parquet 文件个数过多,每个文件太小?突然有一种恍然大悟的感觉,赶紧看看现在 hdfs 上文件的结构,如下所示:


@mac007:~/Desktop/dyes/git-mercury/mercury-computing$hadoop fs -ls -h hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ | cat -n | tail
317 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 1.3 M 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00310-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet
318 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 1.4 M 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00311-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet
319 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 2.9 M 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00312-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet
320 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 1.2 M 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00313-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet
321 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 1.9 M 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00314-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet
322 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 1.7 M 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00315-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet
323 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 899.4 K 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00316-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet
324 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 2.3 M 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00317-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet
325 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 1.0 M 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00318-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet
326 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 460.9 K 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00319-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet


可以看到,现在有 300 多个文件【上面只是一部分,还有十几个在另外一个文件夹里,一个 sql 会统计两个文件夹里的数据文件】,而且我仔细看了一下,每个文件大小最小的有很多 1kb 的,最大的有 2.9mb 的。难怪了,原来核心根源在这里。再结合上面关于 metrics 的分析,我心里大概确信了,只要把 parquet 文件的问题解决就行了,方法就是压缩 parquet 文件个数,控制每个 parquet 文件的大小即可。方法确定了,那就干咯。

4. 效果对比

未来方便对比,我把 20161212 的数据文件处理了一下,保留 20161117 这天的数据文件【20161212 的数据文件整体上比 20161117 的数据文件要多 10%】,下面是对比结果:
parquet 文件个数
  • 20161117 这天

taotao@mac007:~/Desktop/dyes/git-mercury/mercury-computing$hadoop fs -ls -h hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_S* | cat -n | tail -n 5
342 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 1.7 M 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00315-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet
343 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 899.4 K 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00316-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet
344 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 2.3 M 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00317-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet
345 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 1.0 M 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00318-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet
346 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 460.9 K 2016-11-17 16:37 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161117/20161117_Transaction_SZ/part-r-00319-38d7cc53-60d2-40b3-a945-0cb5832f30de.gz.parquet
  • 20161212 这天

taotao@mac007:~/Desktop/dyes/git-mercury/mercury-computing$hadoop fs -ls -h hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161212/20161212_Transaction_S* | cat -n | tail -n 5
34 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 19.2 M 2016-12-12 15:49 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161212/20161212_Transaction_SZ/part-r-00013-686bbce5-a7a1-4b5d-b25c-14cd9ddae283.gz.parquet
35 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 10.7 M 2016-12-12 15:49 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161212/20161212_Transaction_SZ/part-r-00014-686bbce5-a7a1-4b5d-b25c-14cd9ddae283.gz.parquet
36 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 26.0 M 2016-12-12 15:49 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161212/20161212_Transaction_SZ/part-r-00015-686bbce5-a7a1-4b5d-b25c-14cd9ddae283.gz.parquet
37 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 20.1 M 2016-12-12 15:49 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161212/20161212_Transaction_SZ/part-r-00016-686bbce5-a7a1-4b5d-b25c-14cd9ddae283.gz.parquet
38 -rw-r--r-- 3 taotao hfmkt 8.7 M 2016-12-12 15:49 hdfs://hadoop-archive-cluster/hfmkt/level2/datayes/parquet/20161212/20161212_Transaction_SZ/part-r-00017-686bbce5-a7a1-4b5d-b25c-14cd9ddae283.gz.parquet


100个job并发执行时间
  • 20161117 这天:99s

  • 20161212 这天:16s

Spark Web UI 上一个 job 对比
  • 20161117 这天

 
  • 20161212 这天

5. 总结

首先,需要说明的是,这次优化应该还有提升的空间,虽然优化后整体从 204s 到 99s 再到 16s,提升了十倍多,确实很大,但是最后我们还是发现 16s 的情况下,scheduler delay 和 Task Deserialization Time 还是有占用了大部分时间,这里我觉得不能一味的在文件个数和大小上下功夫了。需要考虑到用户场景来做一个权衡。所以越到后期的优化,越考验产品功能的设计,当然这是后话了,就不在本文范围内讨论。
其次,这次优化,从发现问题,追根溯源,到最后解决问题,大概花了 1 小时,基本上还算不错。通过这次排查,还是真心感受到 spark 设计的完善,不得不说,作为一个开源项目,spark 最大的特点,我觉得应该是 spark 是由一帮非程序员设计实现的,而是一帮由程序员,架构师,产品经理组合起来一起干的,更像是一个产品,而不是一个开源项目。



超全Spark性能优化总结

一次SparkSQL性能分析与优化之旅及相关工具小结

基于 Spark 技术快速构建数仓项目



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本文为大数据技术与架构原创整理,转载需作者授权。未经作者允许转载追究侵权责任。
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编辑 | 《大数据技术与架构》
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