这个工具可以组合参数画出2种单细胞Marker显示图
生信宝典
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2020-12-06 18:47
今天有好友在微信群问起
是不是 生信宝典之前出过一个绘制这个图的教程?
想了下,免费在线绘图平台ImageGP应该可以绘制!
每次如果不提免费总有人问是否收费?
测试了下,效果如下,跟上面的不太一样。
想着修改下程序来支持单细胞Marker图的绘制
再想一下应该可以调整参数画出跟示例图一致的布局,
果然, 调整了下 类似的图就出来了!
加一个带分享的效果!
(扫码访问绘图网站,不要问我码在哪)
参数如下(标记的有些随意了)
关键参数都是跟输入数据有关,横轴是基因,纵轴是表达谱,按细胞簇进行分面 (facet),每面一个 (facet row)。
然后做下旋转 (Box direction),再设置下单细胞特有的facet样式 (specify normal single cell expression profile facet styles)。
欢迎大家提出更多绘图需求,我们也在设计把这些常见专用图的参数固化,只需输入数据就可以绘图专用图,进一步降低学习成本。
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