【Python】这个装饰器竟让 Python 提速了 30 倍!

机器学习初学者

共 5193字,需浏览 11分钟

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2022-12-08 16:09

Python是一种解释语言,其代码不是直接编译成机器码,而是由另一个叫做 解释器 的程序实时解释的(一般是 cpython )。因此,与其他编译语言相比,Python灵活性高(动态类型,兼容性高,...)。但这也造成了Python非常慢的缺点。

加速 Python的方法

实际上,有多种解决方案可以解决python的缓慢问题。

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  • 使用 cython:一种编程语言,是python的超集。Cython是Python编程语言和扩展 Cython 编程语言(基于Pyrex)的优化静态编译器。它使得为 Python 编写 C 扩展就像 Python 本身一样容易。
  • 使用C/C++语言结合 ctypes pybind11 CFFI 来编写Python的绑定程序
  • 用C/C++扩展Python
  • 使用其他编译过的语言,如rust[1]

而所有这些方法,都需要使用除Python外的另一种语言,并编译代码使之与Python一起工作。尽管这些方法都很不错,但并不是最适合我们初学者的使python更快的方法,更别提他们通常比较难以设置了。

Numba & JIT 编译器

Numba[2]是一个Python包,在兼具Python的便利的同时,可以使你的代码更快。

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numba使用Just-in-time (JIT)编译(即在Python代码执行过程中的实时编译的),使用起来非常方便,无需向其他工具一样,还需安装一个C/C++编译器,它仅需用 pip/conda 安装它即可。

      pip install numba

接下来试一个例子:用蒙特卡洛模拟来计算π的估计值。

      import random
from numba import njit
def monte_carlo_pi_without_numba(nsamples):
    acc = 0
    for i in range(nsamples):
        x = random.random()
        y = random.random()
        if (x ** 2 + y ** 2) < 1.0:
            acc += 1
    return 4.0 * acc / nsamples

# 添加numba的装饰器,使该函数更快。
@njit
def monte_carlo_pi_with_numba(nsamples):
    acc = 0
    for i in range(nsamples):
        x = random.random()
        y = random.random()
        if (x ** 2 + y ** 2) < 1.0:
            acc += 1
    return 4.0 * acc / nsamples

在使用该方法时,我们只需要导入numba的一个装饰器(njit),剩下的都由它自己完成即可,可以说是非常方便。

我们运行两个版本的代码,并进行计时对比。显示numba比普通python快30倍

      %timeit monte_carlo_pi_with_numba(100_000)
# 1.24 ms ± 10.4 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)

%timeit monte_carlo_pi_without_numba(100_000)
# 40.6 ms ± 814 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 10 loops each)

一些注意事项

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值得一提的是,numba确实有一些缺点:

  • 在首次运行numba装饰的函数时,有一定的时间开销。这是因为首次执行时,numba会试图找出参数的类型并编译函数,从而导致程序有一定的延迟。
  • 不是所有的Python代码都能用numba编译,例如,如果你对同一个变量或对列表元素使用混合数据类型,此种情况将会抛出异常。

加速 Pandas

Numba是专门为numpy设计的,对numpy数组非常友好。而 pandas 是建立在 numpy 之上的,这使得在使用用户定义的函数或甚至执行不同的Dataframe操作时,可以进行疯狂优化。

6f4295f9aaa25c58a19d46fad80b7cdc.webp

首先创建一个DataFrame数据集。

      import numpy as np
import pandas as pd

n = 1_000_000

df = pd.DataFrame({
    'height'1 + 1.3 * np.random.random(n),
    'weight'40 + 260 * np.random.random(n),
    'hip_circumference'94 + 14 * np.random.random(n)
})

用户定义的函数

numba 的另一个重要的方法是 vectorize,使用该方法可以很容易的创建numpy通用函数(ufuncs[3])

通用函数(或简称ufunc)是以ndarrays逐个元素的方式运行的函数,支持数组广播、类型转换和其他几个标准特性。也就是说,ufunc 是一个函数的“矢量化”包装器,它接受固定数量的特定输入并产生固定数量的特定输出。

下面是计算数据集中列height的平方。

      from numba import vectorize

def get_squared_height_without_numba(height):
  return height ** 2

@vectorize
def get_squared_height_with_numba(height):
  return height ** 2

%timeit df['height'].apply(get_squared_height_without_numba)
# 279 ms ± 7.31 ms per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1 loop each)


%timeit df['height'] ** 2
# 2.04 ms ± 229 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)

# 我们首先将列转换为numpy数组,
# 因为numba与numpy兼容,与pandas并不兼容。
%timeit get_squared_height_with_numba(df['height'].to_numpy())
# 1.6 ms ± 51.5 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)

基本操作

使用njit,并计算 BMI(身体质量指数)。

      from numba import njit

@njit
def get_bmi(weight_col, height_col):
  n = len(weight_col)
  result = np.empty(n, dtype="float64")

  # 与python循环相比,Numba的循环非常快
  for i, (weight, height) in enumerate(zip(weight_col, height_col)):
    result[i] = weight / (height ** 2)
  return result

# 不要忘记将列转换为 numpy 
%timeit df['bmi'] = get_bmi(df['weight'].to_numpy(), 
                            df['height'].to_numpy())
# 6.77 ms ± 230 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)

%timeit df['bmi'] = df['weight']  / (df['height'] ** 2)
# 8.63 ms ± 316 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 100 loops each)

你可以看到,即使是基本的操作,numba仍然比原始 pandas 花费的时间更少(6.77ms vs 8.63ms)。

写在最后

numba 是一种开箱即用的方法,可以轻而易举地 让你的 Python 代码变得更快。当然,在成功编译代码之前可能需要多几次尝试,你可以试试使用它。如果本文对你有用,那就点个赞和在看支持下云朵君吧

拓展阅读

[1]

rust: https://github.com/PyO3/pyo3

[2]

Numba: https://numba.pydata.org/

[3]

ufuncs: https://numpy.org/doc/stable/reference/ufuncs.html

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                                          往期
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