Visinets：一个可以让你的信号通路图动起来的网站！
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2021-03-02 14:04
之前我们介绍过许多信号通路图的查找和制作网站，但这些信号通路都有一个特点，他不具备动态性，我们需要靠脑补来想这个基因激活了一个基因，抑制了另外一个基因，转来转去就绕晕了，有没有一个网站能够动态展示这些信号通路的流向呢？
还真有一个，这就是今天推荐给大家的在线绘制信号通路的工具网站Visinets。
Visinets
网址：http://www.visinets.com/pathway/list
点击左侧的蓝色按钮就可以创建自己的信号通路图了，右侧则是网站已经做好的信号通路图，如果你只是在原有的基础上进行添补的话，可以找现成的信号通路图进行修改。
点击进入信号通路的画板，我们可以看到上方和左侧都有四个选项，分别是Species、Influence、Compartment和Labels。点击上方的按钮就可以画出相应的项目，点击左侧的按钮就可以调整相应的参数，比如influence中绿色箭头代表促进、红色箭头代表抑制等。
可以看出想用这个软件画出绚丽多彩的信号通路图还是比较难的，需要调节很多参数，但是他的特色其实不在于画，而在于动，而且网站提供了常见的信号通路图，我们只需要稍加利用，就可以产出我们需要的动态信号通路来。
我们以EGFR信号通路为例。
可以看到EGFR信号通路涉及的基因和传导流向已经标识出来了，如果我们需要在其中添加我们新发现的调节模块，按照前面的操作即可。我们可以看到在左下角有一个播放按钮，只需要点击这个播放键，整个信号通路就流动起来。
这样的信号通路图是不是就好多了，流动起来更能吸引人。大家快去试试吧。
参考文献：
Spychala J, Spychala P, Gomez S, Weinreb GE (2015) Visinets: A Web-Based Pathway Modeling and Dynamic Visualization Tool. PLoS ONE 10(5): e0123773. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0123773
本文由科研小助手（ID：SciRes）原创，转载请注明来源
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