Datapane 009 - API 参考手册

共 9374字,需浏览 19分钟

 ·

2021-02-10 15:52

报告

在本机,在Datapane 托管服务器,创建、分享报告。

创建报告对象

报告对象由一系列组件组成。所有支持组件的完整内容请参阅参考手册的相关页面。

# 创建报告
import datapane as dp

# 创建 Markdown 组件
markdown = dp.Markdown("# My report")

# 创建报告对象
report = dp.Report(markdown)

保存报告

报告可以保存为本机 HTML 文件,使用的参数是 path

report.save(path='file.html')

发布报告

登陆到 Datapane 虚拟机后,可以在线发布报告。name 参数是所有报告的必选参数 。open 参数设置设置为 True 时,将自动打开报告的 URL。如果没有登陆,这个方法会失败。

report.publish(name='my_report', open=True)

发布报告操作的标准输出是 URL,同时还会返回报告对象。

预览报告

在 Jupyter Notebook 里,可以预览内联式报告。

report.preview()

这项操作把本机文件当做 iframe 嵌入到 Notebook 对话里。

API - 报告 - 组件

所有可用于开发与布局的报告组件。

概览

组件用于创建报告。组件与 pandas 的 DataFrame、可视图、Markdown 等 Python 对象兼容。我们还在不断添加新的组件,如果您想在报告里添加新的组件,请在Github 上提交 issue。

可视图

可视图组件支持可视图对象,并在报告里渲染可视图。

目前,Datapane 支持以下可视化支持库:

  • Matplotlib 与 Seaborn

  • Plotly

  • Bokeh

  • Altair

  • Folium

  • 文件与图片

Altair

Altair 是基于 Vega 与 Vega-Light 的声明式 Python 统计可视图支持库。Altair 的 API 基于强大的 Vega-Light 语法,简单、友好、一致性强。这种优雅、简洁的特性,使得 Altair 只需最少的代码,即可生成美观、高效的可视图。

使用 Altair 生成可视图,请参阅 Altair 的文档。

import altair as alt
import datapane as dp
from vega_datasets import data as vega_data
gap = pd.read_json(vega_data.gapminder.url)

select_year = alt.selection_single(
    name='select', fields=['year'], init={'year'1955},
    bind=alt.binding_range(min=1955, max=2005, step=5)
)
alt_chart = alt.Chart(gap).mark_point(filled=True).encode(
    alt.X('fertility', scale=alt.Scale(zero=False)),
    alt.Y('life_expect', scale=alt.Scale(zero=False)),
    alt.Size('pop:Q'),
    alt.Color('cluster:N'),
    alt.Order('pop:Q', sort='descending'),
).add_selection(select_year).transform_filter(select_year)

dp.Report(dp.Plot(alt_chart)).publish(name='time_interval')

Bokeh

Bokeh 是一个交互式可视化支持库,它的图形优雅、简洁,可创建多种多样的图形,并且它为实现大型数据集的高效交互下了很大功夫。

使用 Bokeh 生成可视图,请参阅 Bokeh 的用户文档.

from bokeh.plotting import figure, output_file, show
from bokeh.sampledata.iris import flowers
import datapane as dp 

# 用 Bokeh 创建散点图
colormap = {'setosa''red''versicolor''green''virginica''blue'}
colors = [colormap[x] for x in flowers['species']]

bohek_chart = figure(title = "Iris Morphology")
bokeh_chart.xaxis.axis_label = 'Petal Length'
bokeh_chart.yaxis.axis_label = 'Petal Width'

bokeh_chart.circle(flowers["petal_length"], flowers["petal_width"],
         color=colors, fill_alpha=0.2, size=10)

output_file("iris.html", title="iris.py example")

# 查看可视图
dp.Report(dp.Plot(bokeh_chart)).preview()

# 发布报告
dp.Report(dp.Plot(bokeh_chart)).publish(name='bokeh_plot')

Plotly

Plotly 的 Python 图形支持库 可生成交互式、印刷质量的图形。

import plotly.express as px
import datapane as dp

df = px.data.gapminder()

plotly_chart = px.scatter(df.query("year==2007"), x="gdpPercap", y="lifeExp",
             size="pop", color="continent",
                 hover_name="country", log_x=True, size_max=60)
plotly_chart.show()

dp.Report(dp.Plot(plotly_chart)).publish(name='bubble')

Folium

[Folium] 可在 Python 中轻易实现数据可视化,生成 Leaflet 地图。它可以把数据以分级统计 的形式与地图绑定在一起,还可以在地图上显示多种矢量、光栅、HTML 可视图标记。

该支持库内置一批从 OpenStreet、Mapbox、Stamen 引用的 tileset,还支持调用 Mapbox 或 Cloudmade 的 API 密钥自定义 tileset。

import folium
import datapane as dp 

m = folium.Map(location=[45.5236-122.6750])


dp.Report(dp.Plot(m)).publish(name='folium_map')
https://datapane.com/khuyentran1401/reports/folium_map/

Markdown

Markdown 是一款轻量级标记语言,用于在报告中嵌入文本。

import datapane as dp

dp.Report(dp.Markdown("My awesome markdown"))

要嵌入多行语句和带格式的文字,请使用 “”“这里是文字”“”

import datapane as dp

report = dp.Report(dp.Markdown( "# Altair"),
         dp.Plot(alt_chart),
         dp.Markdown("""
* There is a negative relation between life expectanty and fertility
* The number of population with high life expactancy increases as time increase
          """
)
report.publish(name = 'results')
带 Markdown 的图形

点击这里了解如何使用 Markdown 格式化文本。

代码

参照下例,用 dp.Markdown 分享代码。

code = dp.Markdown(f'''
df = data.reset_index().melt('Date', var_name='symbol', value_name='price')

base_chart = alt.Chart(df).encode(x='Date:T', y='price:Q', color='symbol').interactive()

chart = base_chart.mark_line() if plot_type == 'line' else base_chart.mark_bar()'''
)

dp.Report(code).publish(name='report_with_code')

表格

表格组件使用 pandas 的 DataFrame,并可在 Datapane 报告里渲染支持交互、排序、搜索的表格。用户还可以从网页下载表格。一般情况下,表格组件可以渲染 200至 300 万个单元格,而且不会性能不足的问题。

默认情况下,表格组件只显示前 1000 行数据。修改设置选项,可以显示完整数据集。

import datapane as dp
import pandas as pd

df = pd.DataFrame({
    'A': np.random.normal(-115000),
    'B': np.random.normal(125000),
})

table = dp.Table(df)
report = dp.Report(table)
report.publish(name='sample_table')

文件与图片

Datapane 还支持分享文件与图片。比如,调用 dp.file 就可以分享图片。

dp.File(file=dp.Path('./image.png'))

图片会自动显示在 Datapane 报告里!

查询组件

概览

报告里通常会包含多种组件,但可能只需要嵌入或分享其中某些内容。不必创建包含每种组件的报告,只要指定报告 URL(blocksquery)的查询条件,就可以提取相关组件。

这里使用 XPath 实现查询报告的内容。除下列查询示例之外,还可以使用任何有效的 XPath 查询条件。

组件类型

在链接中指定以下四种组件类型,即可访问对不同组件:

  • Table:提取 DataFrame

  • Plot:提取可视图

  • Text:提取 Markdown 文本

  • File:提取文件或图片

查询特定的组件类型

假设报告中使用了 Markdown 文本与可视图组件。如需分享报告里的可视图,只需在报告链接的末尾添加 /?blocksquery=//Plot

比如,要提取这个报告中的可视图:
https://datapane.com/ryancahildebrandt/reports/movies_dashboard_3496f91c/

只需要在链接末尾添加 /?blocksquery=//Plot
https://datapane.com/ryancahildebrandt/reports/movies_dashboard_3496f91c/embed/?blocksquery=//Plot

只显示可视图组件:

访问指定组件

假如只想显示报告里的第一张可视图,只要在链接末尾添加 /?blocksquery=//Plot[1]。比如,这个链接就只显示第一张可视图。
https://datapane.com/ryancahildebrandt/reports/movies_dashboard_3496f91c/embed/?blocksquery=//Plot[1]

下面这个链接显示第二张可视图。https://datapane.com/ryancahildebrandt/reports/movies_dashboard_3496f91c/embed/?blocksquery=//Plot[2]

脚本 - 配置

配置 Datapane 的 Python 脚本


datapane.yaml 文件里,可以设置下列选项:

script

相对路径。

说明

Python 脚本或 Jupyter Notebook 的路径,是脚本的基础内容。默认为 dp_script.py

name

字符串(支持的字符串为 [a-z0-9_]

说明

脚本的名称,显示在网页界面上。

部署多个同名的脚本将自动递增生成不同版本。

pre_commands

bash 命令列表。

说明

脚本执行前运行的 bash 命令列表。该项操作常用于部署时安装 include 项下的本机文件夹中的 pip 依赖项,或从 git 提取数据。

include

文件或文件夹的相对路径列表。

说明

脚本中包含的本机文件或文件夹。脚本运行时,这些内容在当前工作文件夹生效,因此可用于上传本地支持库、源文件、SQL 脚本等。

对于大型文件与二进制对象,建议使用 Blob API。

exclude

文件或文件夹的相对路径列表。

说明

部署时明确要排除的文件(在 include 中指定的文件或文件夹除外)。

parameters

对象列表。

说明

转换为网页表单并在运行时传递给代码的参数列表。由对象列表组成,如下:

parameters: 
  - name: my_param
    type: string
    default: foo

requirements

与 pip 兼容的安装包列表

说明

脚本运行前需要安装的支持库列表。与平时在 requirements.txt 文件里的内容一样。

每次脚本运行时,都会安装这些参数,因此,如果这里的参数很多,在执行脚本时会产生延迟。如需不断复用同样的参数,或使用更复杂的需求项,建议在 Docker 镜像中添加需求项,并指定 container_image_name

container_image_name

Docker URL

说明

运行脚本的公开 Docker 镜像。关于创建镜像的说明,请参阅下列教程。

支持库与依赖项

repo

URL

说明

GitHub 库或文件的链接。这里的内容在网页界面以引用的形式显示,不影响代码执行。

Blob 对象

Blob 对象是可以存储到 Datapane 或在脚本中使用的文件和对象。


生成报告经常需要数据集、模型、文件等非代码类的资源。很多情况下,和脚本一起部署这些资源并不是什么好主意。

  1. 部署节奏与脚本不同。例如,模型每日都要进行训练,但脚本代码却是静态不变的。

  2. 部署环境与脚本不同。例如,要在脚本中使用在 Segemaker 上训练的模型。

  3. Blob 对象一般很大,每次部署时重新上传都麻烦。

对于这些用例,Datapane 提供了 Blob API,可以从任何 Python 或 CLI 环境上传文件,并在脚本内部或通过 CLI 访问这些对象。

CLI

上传 upload

上传文件,并返回提取 Blob 对象的 id 和 URL。

datapane blob upload  

下载 download

下载 Blob 对象,并保存为文件。

datapane blob download   [--version=version]

Python

上传 DataFrame、文件、对象 `upload_df,upload_file,upload_obj`

参数

所有上传方法的第一个参数都是要上传的对象。针对以上三种方法,该参数可以是 DataFrame、文件路径、Python 对象。

上述三种方法都支持以下参数:

参数说明是否必选
name变量的值
version可见权限设置(ORGPRIVATEPUBLIC
参数说明是否必选
name变量的值
version可见权限设置(ORGPRIVATEPUBLIC

团队其他成员在他们的脚本里调用您创建的 Blob 对象时,必须将该对象的可见权限设置为 ORG

import datapane as dp

# 上传 DataFrame
b = dp.Blob.upload_df(df, name='my_df')

# 上传文件
b = dp.Blob.upload_file("~/my_dataset.csv", name='my_ds')

# 上传对象
b = dp.Blob.upload_obj([1,2,3], name='my_list')

下载文件、DataFrame、对象 `download_df、download_file、download_obj`

下载 DataFrame、文件、对象。所有下载操作都需要以下参数:

参数说明是否必选
nameBlob 对象的名称
versionBlob 对象的版本
ownerBlob 对象的所有权人

团队其他成员要运行您的脚本,访问您创建的 Blob 对象,则必须在此方法中指定您自己作为 owner。他人运行您的脚本时,是以他们的账户名运行的,如果没有明确地指定 owner, 脚本会在他们名下查找 Blob 对象,这将导致运行失败。

dp.Blob.get(name='foo', owner='linus')
import datapane as dp

# 下载 DataFrame
blob = dp.Blob.get(name="blob_id")

# 下载 DataFrame
b = blob.download_df()

# 下载文件
b = blob.download_file("~/my_dataset.csv")

# 下载对象
b = blob.download_obj()

分享 Blob 对象

有时要把 Blob 对象分享给团队其他成员,以便整个团队使用同一个 DataFrame、对象、文件开展工作。

向外部公众分享 Blob 对象,在上传 DataFrame、文件、对象时,要将可见权限设置为 visibility=PUBLIC

dp.Blob.upload_df(df, name='myblob', visibility='PUBLIC')

他人想访问您的 Blob 对象时,只需指定的 Blob 对象的名称,并在 owner 参数中注明您的账户名即可。

blob = dp.Blob.get(name='myblob', owner='khuyentran')

# 提取 Blob 对象
b = blob.download_df() # 或 download_file(),download_obj()

现在,他们就可以在自己的代码中使用您的 Blob 对象了!在团队内部分享 Blob 对象,也可以用相同流程,但要把 Blob 对象的可见权限设置为 ORG

变量

变量是可在不同脚本之间共享,且经过加密的私密值。

概览

脚本里通常都含有数据库密钥、密码等变量,这些变量不宜嵌入源代码,也不宜让外界公众看到。Datapane 的 Variable 对象提供了一种安全的方式,用于创建、存储、提取脚本所需的值。

添加变量 `add`

参数

参数说明是否必选
name变量名
value变量值
visibility可见权限设置(ORG、PRIVATE、PUBLIC)

返回对象

变量对象

说明与示例

创建新的用户变量。变量名相同,但变量值不同时,此命令将创建新版本的变量。

默认情况下,变量是创建者账户私有的内容,但也能在团队内部分享。可以设置可见权限,把 --visibility 标签(或 Python 里的 visibility 项)设置为 OWNER_ONLYORG

团队其他成员运行您发布的脚本时,要把变量的可见权限设置为 ORG, 这样才能在他们的账户下运行您的脚本。

# CLI
~/> datapane variable add  
Created variable: 
# Python

import datapane as dp
v = dp.Variable.add(name, value, visibility='ORG')

列出变量 `list`

参数

返回对象

变量名与变量版本的列表

说明与示例

# CLI

~/> datapane variable list
Available Variables:
    name      versions
--  ------  ----------
 0  foo              1

提取变量 `get`

参数

参数说明是否必选
name变量名
version提取的变量版本
owner变量的所有者。默认为运行脚本的人。因此,如需他人运行您创建的变量,要显式设置可见权限

返回对象

单个变量对象

说明与示例

默认情况下,get 提取变量的最新版本。

如需团队其他成员运行脚本时调用您创建的变量,在本方法中,必须指定您自己为 owner。他人运行您的脚本时,该脚本在他们自己的账户名下运行,如果没有明确地指定 owner,Datapane 将在他们的账户名下查找变量,这将导致程序运行失败。

foo = dp.Variable.get(name='foo', owner='linus')
# CLI

~/> datapane variable get foo
Available Variable:
    name     value    visibility
--  -------  -------  ------------
 0  foo      bar      OWNER_ONLY
 # Python

 import datapane as dp

v = dp.Variable.get(name='foo')

提取值

用以下命令提取存在 foo 里的值:

foo_value = foo.value

删除变量 `delete`

参数

参数说明是否必选
name变量名

返回对象

说明与示例

# CLI

~/> datapane variable delete foo   
Deleted variable foo


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