13个PyTorch特性小技巧,“炼丹”提速,直接上手!
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·
2021-04-14 20:28
PyTorch使用上的13个特性,确实非常的有用。
PyTorch在学术界和工业界的应用研究中都获得了很多关注。它是一个具有很大灵活性的深度学习框架,使用了大量的实用工具和函数来加快工作速度。PyTorch的学习曲线并不是那么陡峭,但在其中实现高效和干净的代码可能会很棘手。在使用它超过2年之后,以下是我最喜欢的PyTorch功能,我希望我一开始学习它就知道。
1. DatasetFolder
当学习PyTorch时,人们首先要做的事情之一是实现自己的某种Dataset
。这是一个低级错误,没有必要浪费时间写这样的东西。通常,数据集要么是数据列表(或者是numpy数组),要么磁盘上的文件。所以,把数据在磁盘上组织好,要比写一个自定义的Dataset
来加载某种奇怪的格式更好。
分类器最常见的数据格式之一,是有一个带有子文件夹的目录,子文件夹表示类,子文件夹中的文件表示样本,如下所示。
folder/class_0/file1.txt
folder/class_0/file2.txt
folder/class_0/...
folder/class_1/file3.txt
folder/class_1/file4.txt
folder/class_2/file5.txt
folder/class_2/...
有一个内置的方式来加载这类数据集,不管你的数据是图像,文本文件或其他什么,只要使用'DatasetFolder
就可以了。令人惊讶的是,这个类是torchvision
包的一部分,而不是核心PyTorch。这个类非常全面,你可以从文件夹中过滤文件,使用自定义代码加载它们,并动态转换原始文件。例子:
from torchvision.datasets import DatasetFolder
from pathlib import Path
# I have text files in this folder
ds = DatasetFolder("/Users/marcin/Dev/tmp/my_text_dataset",
loader=lambda path: Path(path).read_text(),
extensions=(".txt",), #only load .txt files
transform=lambda text: text[:100], # only take first 100 characters
)
# Everything you need is already there
len(ds), ds.classes, ds.class_to_idx
(20, ['novels', 'thrillers'], {'novels': 0, 'thrillers': 1})
如果你在处理图像,还有一个torchvision.datasets.ImageFolder
类,它基于DatasetLoader
,它被预先配置为加载图像。
2. 尽量少用 .to(device)
,用 zeros_like
/ ones_like
之类的代替
我读过很多来自GitHub仓库的PyTorch代码。最让我恼火的是,几乎在每个repo中都有许多*.to(device)
行,它们将数据从CPU或GPU转移到其他地方。这样的语句通常会出现在大量的repos或初学者教程中。我强烈建议尽可能少地实现这类操作,并依赖内置的PyTorch功能自动实现这类操作。到处使用.to(device)
通常会导致性能下降,还会出现异常:
Expected object of device type cuda but got device type cpu
显然,有些情况下你无法回避它,但大多数情况(如果不是全部)都在这里。其中一种情况是初始化一个全0或全1的张量,这在深度神经网络计算损失的的时候是经常发生的,模型的输出已经在cuda上了,你需要另外的tensor也是在cuda上,这时,你可以使用*_like
操作符:
my_output # on any device, if it's cuda then my_zeros will also be on cuda
my_zeros = torch.zeros_like(my_output_from_model)
在内部,PyTorch所做的是调用以下操作:
my_zeros = torch.zeros(my_output.size(), dtype=my_output.dtype, layout=my_output.layout, device=my_output.device)
所以所有的设置都是正确的,这样就减少了代码中出现错误的概率。类似的操作包括:
torch.zeros_like()
torch.ones_like()
torch.rand_like()
torch.randn_like()
torch.randint_like()
torch.empty_like()
torch.full_like()
3. Register Buffer ( nn.Module.register_buffer
)
这将是我劝人们不要到处使用 .to(device)
的下一步。有时,你的模型或损失函数需要有预先设置的参数,并在调用forward
时使用,例如,它可以是一个“权重”参数,它可以缩放损失或一些固定张量,它不会改变,但每次都使用。对于这种情况,请使用nn.Module.register_buffer
方法,它告诉PyTorch将传递给它的值存储在模块中,并将这些值随模块一起移动。如果你初始化你的模块,然后将它移动到GPU,这些值也会自动移动。此外,如果你保存模块的状态,buffers也会被保存!
一旦注册,这些值就可以在forward函数中访问,就像其他模块的属性一样。
from torch import nn
import torch
class ModuleWithCustomValues(nn.Module):
def __init__(self, weights, alpha):
super().__init__()
self.register_buffer("weights", torch.tensor(weights))
self.register_buffer("alpha", torch.tensor(alpha))
def forward(self, x):
return x * self.weights + self.alpha
m = ModuleWithCustomValues(
weights=[1.0, 2.0], alpha=1e-4
)
m(torch.tensor([1.23, 4.56]))
tensor([1.2301, 9.1201])
4. Built-in Identity()
有时候,当你使用迁移学习时,你需要用1:1的映射替换一些层,可以用nn.Module
来实现这个目的,只返回输入值。PyTorch内置了这个类。
例子,你想要在分类层之前从一个预训练过的ResNet50
获取图像表示。以下是如何做到这一点:
from torchvision.models import resnet50
model = resnet50(pretrained=True)
model.fc = nn.Identity()
last_layer_output = model(torch.rand((1, 3, 224, 224)))
last_layer_output.shape
torch.Size([1, 2048])
5. Pairwise distances: torch.cdist
下次当你遇到计算两个张量之间的欧几里得距离(或者一般来说:p范数)的问题时,请记住torch.cdist
。它确实做到了这一点,并且在使用欧几里得距离时还自动使用矩阵乘法,从而提高了性能。
points1 = torch.tensor([[0.0, 0.0], [1.0, 1.0], [2.0, 2.0]])
points2 = torch.tensor([[0.0, 0.0], [-1.0, -1.0], [-2.0, -2.0], [-3.0, -3.0]]) # batches don't have to be equal
torch.cdist(points1, points2, p=2.0)
tensor([[0.0000, 1.4142, 2.8284, 4.2426],
[1.4142, 2.8284, 4.2426, 5.6569],
[2.8284, 4.2426, 5.6569, 7.0711]])
没有矩阵乘法或有矩阵乘法的性能,在我的机器上使用mm时,速度快了2倍以上。
%%timeit
points1 = torch.rand((512, 2))
points2 = torch.rand((512, 2))
torch.cdist(points1, points2, p=2.0, compute_mode="donot_use_mm_for_euclid_dist")
867µs±142µs per loop (mean±std. dev. of 7 run, 1000 loop each)
%%timeit
points1 = torch.rand((512, 2))
points2 = torch.rand((512, 2))
torch.cdist(points1, points2, p=2.0)
417µs±52.9µs per loop (mean±std. dev. of 7 run, 1000 loop each)
6. Cosine similarity: F.cosine_similarity
与上一点相同,计算欧几里得距离并不总是你需要的东西。当处理向量时,通常余弦相似度是选择的度量。PyTorch也有一个内置的余弦相似度实现。
import torch.nn.functional as F
vector1 = torch.tensor([0.0, 1.0])
vector2 = torch.tensor([0.05, 1.0])
print(F.cosine_similarity(vector1, vector2, dim=0))
vector3 = torch.tensor([0.0, -1.0])
print(F.cosine_similarity(vector1, vector3, dim=0))
tensor(0.9988)
tensor(-1.)
PyTorch中批量计算余弦距离
import torch.nn.functional as F
batch_of_vectors = torch.rand((4, 64))
similarity_matrix = F.cosine_similarity(batch_of_vectors.unsqueeze(1), batch_of_vectors.unsqueeze(0), dim=2)
similarity_matrix
tensor([[1.0000, 0.6922, 0.6480, 0.6789],
[0.6922, 1.0000, 0.7143, 0.7172],
[0.6480, 0.7143, 1.0000, 0.7312],
[0.6789, 0.7172, 0.7312, 1.0000]])
7. 归一化向量: F.normalize
最后一点仍然与向量和距离有松散的联系,那就是归一化:通常是通过改变向量的大小来提高计算的稳定性。最常用的归一化是L2,可以在PyTorch中按如下方式应用:
vector = torch.tensor([99.0, -512.0, 123.0, 0.1, 6.66])
normalized_vector = F.normalize(vector, p=2.0, dim=0)
normalized_vector
tensor([ 1.8476e-01, -9.5552e-01, 2.2955e-01, 1.8662e-04, 1.2429e-02])
在PyTorch中执行归一化的旧方法是:
vector = torch.tensor([99.0, -512.0, 123.0, 0.1, 6.66])
normalized_vector = vector / torch.norm(vector, p=2.0)
normalized_vector
tensor([ 1.8476e-01, -9.5552e-01, 2.2955e-01, 1.8662e-04, 1.2429e-02])
在PyTorch中批量进行L2归一化
batch_of_vectors = torch.rand((4, 64))
normalized_batch_of_vectors = F.normalize(batch_of_vectors, p=2.0, dim=1)
normalized_batch_of_vectors.shape, torch.norm(normalized_batch_of_vectors, dim=1) # all vectors will have length of 1.0
(torch.Size([4, 64]), tensor([1.0000, 1.0000, 1.0000, 1.0000]))
8. 线性层 + 分块技巧 (torch.chunk
)
这是我最近发现的一个有创意的技巧。假设你想把你的输入映射到N个不同的线性投影中。你可以通过创建N个nn.Linear
来做到这一点。或者你也可以创建一个单一的线性层,做一个向前传递,然后将输出分成N块。这种方法通常会带来更高的性能,所以这是一个值得记住的技巧。
d = 1024
batch = torch.rand((8, d))
layers = nn.Linear(d, 128, bias=False), nn.Linear(d, 128, bias=False), nn.Linear(d, 128, bias=False)
one_layer = nn.Linear(d, 128 * 3, bias=False)
%%timeit
o1 = layers[0](batch)
o2 = layers[1](batch)
o3 = layers[2](batch)
289 µs ± 30.8 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
%%timeit
o1, o2, o3 = torch.chunk(one_layer(batch), 3, dim=1)
202 µs ± 8.09 µs per loop (mean ± std. dev. of 7 runs, 1000 loops each)
9. Masked select (torch.masked_select
)
有时你只需要对输入张量的一部分进行计算。给你一个例子:你想计算的损失只在满足某些条件的张量上。为了做到这一点,你可以使用torch.masked_select
,注意,当需要梯度时也可以使用这个操作。
data = torch.rand((3, 3)).requires_grad_()
print(data)
mask = data > data.mean()
print(mask)
torch.masked_select(data, mask)
tensor([[0.0582, 0.7170, 0.7713],
[0.9458, 0.2597, 0.6711],
[0.2828, 0.2232, 0.1981]], requires_grad=True)
tensor([[False, True, True],
[ True, False, True],
[False, False, False]])
tensor([0.7170, 0.7713, 0.9458, 0.6711], grad_fn=<MaskedSelectBackward>)
直接在tensor上应用mask
类似的行为可以通过使用mask作为输入张量的 “indexer”来实现。
data[mask]
tensor([0.7170, 0.7713, 0.9458, 0.6711], grad_fn=<IndexBackward>)
有时,一个理想的解决方案是用0填充mask中所有的False
值,可以这样做:
data * mask
tensor([[0.0000, 0.7170, 0.7713],
[0.9458, 0.0000, 0.6711],
[0.0000, 0.0000, 0.0000]], grad_fn=<MulBackward0>)
10. 使用 torch.where
来对tensors加条件
当你想把两个张量结合在一个条件下这个函数很有用,如果条件是真,那么从第一个张量中取元素,如果条件是假,从第二个张量中取元素。
x = torch.tensor([1.0, 2.0, 3.0, 4.0, 5.0], requires_grad=True)
y = -x
condition_or_mask = x <= 3.0
torch.where(condition_or_mask, x, y)
tensor([ 1., 2., 3., -4., -5.], grad_fn=<SWhereBackward>)
11. 在给定的位置给张量填入值(Tensor.scatter
)
这个函数的用例如下,你想用给定位置下另一个张量的值填充一个张量。一维张量更容易理解,所以我将先展示它,然后继续更高级的例子。
data = torch.tensor([1, 2, 3, 4, 5])
index = torch.tensor([0, 1])
values = torch.tensor([-1, -2, -3, -4, -5])
data.scatter(0, index, values)
tensor([-1, -2, 3, 4, 5])
上面的例子很简单,但是现在看看如果将index改为index = torch.tensor([0, 1, 4])
会发生什么:
data = torch.tensor([1, 2, 3, 4, 5])
index = torch.tensor([0, 1, 4])
values = torch.tensor([-1, -2, -3, -4, -5])
data.scatter(0, index, values)
tensor([-1, -2, 3, 4, -3])
为什么最后一个值是-3,这是反直觉的,对吧?这是PyTorch scatter
函数的中心思想。index
变量表示data
张量的第i个值应该放在values
张量的哪个位置。我希望下面的简单python版的这个操作能让你更明白:
data_orig = torch.tensor([1, 2, 3, 4, 5])
index = torch.tensor([0, 1, 4])
values = torch.tensor([-1, -2, -3, -4, -5])
scattered = data_orig.scatter(0, index, values)
data = data_orig.clone()
for idx_in_values, where_to_put_the_value in enumerate(index):
what_value_to_put = values[idx_in_values]
data[where_to_put_the_value] = what_value_to_put
data, scattered
(tensor([-1, -2, 3, 4, -3]), tensor([-1, -2, 3, 4, -3]))
2D数据的PyTorch scatter例子
始终记住,index
的形状与values
的形状相关,而index
中的值对应于data
中的位置。
data = torch.zeros((4, 4)).float()
index = torch.tensor([
[0, 1],
[2, 3],
[0, 3],
[1, 2]
])
values = torch.arange(1, 9).float().view(4, 2)
values, data.scatter(1, index, values)
(tensor([[1., 2.],
[3., 4.],
[5., 6.],
[7., 8.]]),
tensor([[1., 2., 0., 0.],
[0., 0., 3., 4.],
[5., 0., 0., 6.],
[0., 7., 8., 0.]]))
12. 在网络中进行图像插值 (F.interpolate
)
当我学习PyTorch时,我惊讶地发现,实际上可以在前向传递中调整图像(或任何中间张量),并保持梯度流。这种方法在使用CNN和GANs时特别有用。
# image from https://commons.wikimedia.org/wiki/File:A_female_British_Shorthair_at_the_age_of_20_months.jpg
img = Image.open("./cat.jpg")
img
to_pil_image(
F.interpolate(to_tensor(img).unsqueeze(0), # batch of size 1
mode="bilinear",
scale_factor=2.0,
align_corners=False).squeeze(0) # remove batch dimension
)
看看梯度流是如何保存的:
F.interpolate(to_tensor(img).unsqueeze(0).requires_grad_(),
mode="bicubic",
scale_factor=2.0,
align_corners=False)
tensor([[[[0.9216, 0.9216, 0.9216, ..., 0.8361, 0.8272, 0.8219],
[0.9214, 0.9214, 0.9214, ..., 0.8361, 0.8272, 0.8219],
[0.9212, 0.9212, 0.9212, ..., 0.8361, 0.8272, 0.8219],
...,
[0.9098, 0.9098, 0.9098, ..., 0.3592, 0.3486, 0.3421],
[0.9098, 0.9098, 0.9098, ..., 0.3566, 0.3463, 0.3400],
[0.9098, 0.9098, 0.9098, ..., 0.3550, 0.3449, 0.3387]],
[[0.6627, 0.6627, 0.6627, ..., 0.5380, 0.5292, 0.5238],
[0.6626, 0.6626, 0.6626, ..., 0.5380, 0.5292, 0.5238],
[0.6623, 0.6623, 0.6623, ..., 0.5380, 0.5292, 0.5238],
...,
[0.6196, 0.6196, 0.6196, ..., 0.3631, 0.3525, 0.3461],
[0.6196, 0.6196, 0.6196, ..., 0.3605, 0.3502, 0.3439],
[0.6196, 0.6196, 0.6196, ..., 0.3589, 0.3488, 0.3426]],
[[0.4353, 0.4353, 0.4353, ..., 0.1913, 0.1835, 0.1787],
[0.4352, 0.4352, 0.4352, ..., 0.1913, 0.1835, 0.1787],
[0.4349, 0.4349, 0.4349, ..., 0.1913, 0.1835, 0.1787],
...,
[0.3333, 0.3333, 0.3333, ..., 0.3827, 0.3721, 0.3657],
[0.3333, 0.3333, 0.3333, ..., 0.3801, 0.3698, 0.3635],
[0.3333, 0.3333, 0.3333, ..., 0.3785, 0.3684, 0.3622]]]],
grad_fn=<UpsampleBicubic2DBackward1>)
13. 将图像做成网格 (torchvision.utils.make_grid
)
当使用PyTorch和torchvision时,不需要使用matplotlib或一些外部库来复制粘贴代码来显示图像网格。只要使用torchvision.utils.make_grid
就行了。
from torchvision.utils import make_grid
from torchvision.transforms.functional import to_tensor, to_pil_image
from PIL import Image
img = Image.open("./cat.jpg")
to_pil_image(
make_grid(
[to_tensor(i) for i in [img, img, img]],
nrow=2, # number of images in single row
padding=5 # "frame" size
)
)
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